Protein–RNA interactions for Protein: Q3THK3

Gtf2f1, General transcription factor IIF subunit 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf2f1Q3THK3 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gtf2f1Q3THK3 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gtf2f1Q3THK3 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gtf2f1Q3THK3 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gtf2f1Q3THK3 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gtf2f1Q3THK3 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gtf2f1Q3THK3 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gtf2f1Q3THK3 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gtf2f1Q3THK3 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gtf2f1Q3THK3 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gtf2f1Q3THK3 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gtf2f1Q3THK3 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gtf2f1Q3THK3 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gtf2f1Q3THK3 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gtf2f1Q3THK3 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gtf2f1Q3THK3 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gtf2f1Q3THK3 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gtf2f1Q3THK3 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gtf2f1Q3THK3 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gtf2f1Q3THK3 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gtf2f1Q3THK3 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gtf2f1Q3THK3 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gtf2f1Q3THK3 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gtf2f1Q3THK3 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gtf2f1Q3THK3 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gtf2f1Q3THK3 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gtf2f1Q3THK3 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gtf2f1Q3THK3 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gtf2f1Q3THK3 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gtf2f1Q3THK3 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Gtf2f1Q3THK3 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Gtf2f1Q3THK3 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gtf2f1Q3THK3 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gtf2f1Q3THK3 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gtf2f1Q3THK3 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gtf2f1Q3THK3 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gtf2f1Q3THK3 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gtf2f1Q3THK3 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gtf2f1Q3THK3 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gtf2f1Q3THK3 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gtf2f1Q3THK3 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gtf2f1Q3THK3 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gtf2f1Q3THK3 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gtf2f1Q3THK3 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gtf2f1Q3THK3 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gtf2f1Q3THK3 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gtf2f1Q3THK3 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gtf2f1Q3THK3 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gtf2f1Q3THK3 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gtf2f1Q3THK3 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gtf2f1Q3THK3 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gtf2f1Q3THK3 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gtf2f1Q3THK3 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gtf2f1Q3THK3 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gtf2f1Q3THK3 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gtf2f1Q3THK3 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gtf2f1Q3THK3 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gtf2f1Q3THK3 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gtf2f1Q3THK3 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gtf2f1Q3THK3 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gtf2f1Q3THK3 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gtf2f1Q3THK3 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gtf2f1Q3THK3 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gtf2f1Q3THK3 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gtf2f1Q3THK3 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gtf2f1Q3THK3 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gtf2f1Q3THK3 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gtf2f1Q3THK3 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gtf2f1Q3THK3 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gtf2f1Q3THK3 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gtf2f1Q3THK3 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gtf2f1Q3THK3 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gtf2f1Q3THK3 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gtf2f1Q3THK3 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gtf2f1Q3THK3 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gtf2f1Q3THK3 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Gtf2f1Q3THK3 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gtf2f1Q3THK3 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gtf2f1Q3THK3 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gtf2f1Q3THK3 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gtf2f1Q3THK3 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gtf2f1Q3THK3 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gtf2f1Q3THK3 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gtf2f1Q3THK3 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gtf2f1Q3THK3 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gtf2f1Q3THK3 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gtf2f1Q3THK3 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gtf2f1Q3THK3 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gtf2f1Q3THK3 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gtf2f1Q3THK3 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gtf2f1Q3THK3 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gtf2f1Q3THK3 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gtf2f1Q3THK3 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gtf2f1Q3THK3 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gtf2f1Q3THK3 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Gtf2f1Q3THK3 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gtf2f1Q3THK3 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gtf2f1Q3THK3 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gtf2f1Q3THK3 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gtf2f1Q3THK3 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.8 ms