Protein–RNA interactions for Protein: Q3SYK4

Vrtn, Vertnin, mousemouse

Predictions only

Length 740 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VrtnQ3SYK4 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
VrtnQ3SYK4 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
VrtnQ3SYK4 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
VrtnQ3SYK4 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
VrtnQ3SYK4 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
VrtnQ3SYK4 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
VrtnQ3SYK4 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
VrtnQ3SYK4 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
VrtnQ3SYK4 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
VrtnQ3SYK4 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
VrtnQ3SYK4 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
VrtnQ3SYK4 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
VrtnQ3SYK4 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
VrtnQ3SYK4 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
VrtnQ3SYK4 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
VrtnQ3SYK4 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
VrtnQ3SYK4 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
VrtnQ3SYK4 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
VrtnQ3SYK4 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
VrtnQ3SYK4 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
VrtnQ3SYK4 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
VrtnQ3SYK4 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
VrtnQ3SYK4 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
VrtnQ3SYK4 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
VrtnQ3SYK4 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
VrtnQ3SYK4 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
VrtnQ3SYK4 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
VrtnQ3SYK4 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
VrtnQ3SYK4 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
VrtnQ3SYK4 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
VrtnQ3SYK4 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
VrtnQ3SYK4 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
VrtnQ3SYK4 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
VrtnQ3SYK4 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
VrtnQ3SYK4 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
VrtnQ3SYK4 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
VrtnQ3SYK4 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
VrtnQ3SYK4 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
VrtnQ3SYK4 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
VrtnQ3SYK4 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
VrtnQ3SYK4 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
VrtnQ3SYK4 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
VrtnQ3SYK4 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
VrtnQ3SYK4 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
VrtnQ3SYK4 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
VrtnQ3SYK4 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
VrtnQ3SYK4 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
VrtnQ3SYK4 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
VrtnQ3SYK4 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
VrtnQ3SYK4 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
VrtnQ3SYK4 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
VrtnQ3SYK4 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
VrtnQ3SYK4 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
VrtnQ3SYK4 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
VrtnQ3SYK4 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
VrtnQ3SYK4 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
VrtnQ3SYK4 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
VrtnQ3SYK4 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
VrtnQ3SYK4 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
VrtnQ3SYK4 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
VrtnQ3SYK4 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
VrtnQ3SYK4 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
VrtnQ3SYK4 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
VrtnQ3SYK4 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
VrtnQ3SYK4 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
VrtnQ3SYK4 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
VrtnQ3SYK4 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
VrtnQ3SYK4 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
VrtnQ3SYK4 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
VrtnQ3SYK4 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
VrtnQ3SYK4 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
VrtnQ3SYK4 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
VrtnQ3SYK4 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
VrtnQ3SYK4 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
VrtnQ3SYK4 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
VrtnQ3SYK4 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
VrtnQ3SYK4 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
VrtnQ3SYK4 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
VrtnQ3SYK4 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
VrtnQ3SYK4 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
VrtnQ3SYK4 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
VrtnQ3SYK4 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
VrtnQ3SYK4 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
VrtnQ3SYK4 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
VrtnQ3SYK4 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
VrtnQ3SYK4 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
VrtnQ3SYK4 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
VrtnQ3SYK4 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
VrtnQ3SYK4 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
VrtnQ3SYK4 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
VrtnQ3SYK4 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
VrtnQ3SYK4 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
VrtnQ3SYK4 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
VrtnQ3SYK4 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
VrtnQ3SYK4 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
VrtnQ3SYK4 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
VrtnQ3SYK4 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
VrtnQ3SYK4 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
VrtnQ3SYK4 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
VrtnQ3SYK4 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 128.9 ms