Protein–RNA interactions for Protein: Q1RNF8

Samd11, Sterile alpha motif domain-containing protein 11, mousemouse

Predictions only

Length 542 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samd11Q1RNF8 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Samd11Q1RNF8 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Samd11Q1RNF8 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Samd11Q1RNF8 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Samd11Q1RNF8 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Samd11Q1RNF8 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Samd11Q1RNF8 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Samd11Q1RNF8 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Samd11Q1RNF8 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Samd11Q1RNF8 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Samd11Q1RNF8 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Samd11Q1RNF8 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Samd11Q1RNF8 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Samd11Q1RNF8 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Samd11Q1RNF8 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Samd11Q1RNF8 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Samd11Q1RNF8 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Samd11Q1RNF8 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Samd11Q1RNF8 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Samd11Q1RNF8 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Samd11Q1RNF8 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Samd11Q1RNF8 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Samd11Q1RNF8 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Samd11Q1RNF8 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Samd11Q1RNF8 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Samd11Q1RNF8 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Samd11Q1RNF8 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Samd11Q1RNF8 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Samd11Q1RNF8 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Samd11Q1RNF8 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Samd11Q1RNF8 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Samd11Q1RNF8 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Samd11Q1RNF8 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Samd11Q1RNF8 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Samd11Q1RNF8 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Samd11Q1RNF8 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Samd11Q1RNF8 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Samd11Q1RNF8 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Samd11Q1RNF8 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Samd11Q1RNF8 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Samd11Q1RNF8 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Samd11Q1RNF8 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Samd11Q1RNF8 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Samd11Q1RNF8 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Samd11Q1RNF8 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.11
Samd11Q1RNF8 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Samd11Q1RNF8 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Samd11Q1RNF8 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Samd11Q1RNF8 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Samd11Q1RNF8 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Samd11Q1RNF8 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Samd11Q1RNF8 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Samd11Q1RNF8 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Samd11Q1RNF8 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Samd11Q1RNF8 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Samd11Q1RNF8 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Samd11Q1RNF8 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Samd11Q1RNF8 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Samd11Q1RNF8 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Samd11Q1RNF8 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Samd11Q1RNF8 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Samd11Q1RNF8 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Samd11Q1RNF8 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Samd11Q1RNF8 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Samd11Q1RNF8 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Samd11Q1RNF8 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Samd11Q1RNF8 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Samd11Q1RNF8 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Samd11Q1RNF8 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Samd11Q1RNF8 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Samd11Q1RNF8 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Samd11Q1RNF8 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Samd11Q1RNF8 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Samd11Q1RNF8 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Samd11Q1RNF8 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Samd11Q1RNF8 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Samd11Q1RNF8 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Samd11Q1RNF8 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Samd11Q1RNF8 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Samd11Q1RNF8 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Samd11Q1RNF8 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Samd11Q1RNF8 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Samd11Q1RNF8 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Samd11Q1RNF8 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Samd11Q1RNF8 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Samd11Q1RNF8 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Samd11Q1RNF8 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Samd11Q1RNF8 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Samd11Q1RNF8 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Samd11Q1RNF8 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Samd11Q1RNF8 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Samd11Q1RNF8 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Samd11Q1RNF8 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Samd11Q1RNF8 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Samd11Q1RNF8 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Samd11Q1RNF8 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Samd11Q1RNF8 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Samd11Q1RNF8 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Samd11Q1RNF8 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Samd11Q1RNF8 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 452.2 ms