Protein–RNA interactions for Protein: Q14406

CSHL1, Chorionic somatomammotropin hormone-like 1, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSHL1Q14406 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CSHL1Q14406 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CSHL1Q14406 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CSHL1Q14406 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CSHL1Q14406 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CSHL1Q14406 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CSHL1Q14406 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CSHL1Q14406 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CSHL1Q14406 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CSHL1Q14406 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CSHL1Q14406 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CSHL1Q14406 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CSHL1Q14406 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CSHL1Q14406 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CSHL1Q14406 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CSHL1Q14406 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CSHL1Q14406 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CSHL1Q14406 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CSHL1Q14406 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CSHL1Q14406 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CSHL1Q14406 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CSHL1Q14406 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CSHL1Q14406 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CSHL1Q14406 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CSHL1Q14406 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CSHL1Q14406 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CSHL1Q14406 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CSHL1Q14406 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CSHL1Q14406 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CSHL1Q14406 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CSHL1Q14406 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CSHL1Q14406 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CSHL1Q14406 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CSHL1Q14406 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CSHL1Q14406 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CSHL1Q14406 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CSHL1Q14406 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CSHL1Q14406 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CSHL1Q14406 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CSHL1Q14406 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CSHL1Q14406 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CSHL1Q14406 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CSHL1Q14406 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CSHL1Q14406 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CSHL1Q14406 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CSHL1Q14406 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CSHL1Q14406 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CSHL1Q14406 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CSHL1Q14406 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CSHL1Q14406 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CSHL1Q14406 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CSHL1Q14406 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CSHL1Q14406 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CSHL1Q14406 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CSHL1Q14406 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CSHL1Q14406 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CSHL1Q14406 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CSHL1Q14406 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CSHL1Q14406 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CSHL1Q14406 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CSHL1Q14406 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CSHL1Q14406 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CSHL1Q14406 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CSHL1Q14406 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CSHL1Q14406 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CSHL1Q14406 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CSHL1Q14406 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CSHL1Q14406 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CSHL1Q14406 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CSHL1Q14406 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CSHL1Q14406 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CSHL1Q14406 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CSHL1Q14406 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CSHL1Q14406 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CSHL1Q14406 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CSHL1Q14406 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CSHL1Q14406 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CSHL1Q14406 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CSHL1Q14406 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CSHL1Q14406 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CSHL1Q14406 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CSHL1Q14406 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
CSHL1Q14406 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CSHL1Q14406 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
CSHL1Q14406 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CSHL1Q14406 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CSHL1Q14406 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CSHL1Q14406 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CSHL1Q14406 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CSHL1Q14406 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
CSHL1Q14406 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CSHL1Q14406 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CSHL1Q14406 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CSHL1Q14406 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CSHL1Q14406 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
CSHL1Q14406 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
CSHL1Q14406 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
CSHL1Q14406 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.11
CSHL1Q14406 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CSHL1Q14406 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62 ms