Protein–RNA interactions for Protein: Q13619

CUL4A, Cullin-4A, humanhuman

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Length 759 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4AQ13619 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CUL4AQ13619 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CUL4AQ13619 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CUL4AQ13619 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CUL4AQ13619 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CUL4AQ13619 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CUL4AQ13619 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CUL4AQ13619 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CUL4AQ13619 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CUL4AQ13619 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CUL4AQ13619 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CUL4AQ13619 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CUL4AQ13619 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CUL4AQ13619 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CUL4AQ13619 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CUL4AQ13619 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CUL4AQ13619 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CUL4AQ13619 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
CUL4AQ13619 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CUL4AQ13619 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CUL4AQ13619 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CUL4AQ13619 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CUL4AQ13619 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
CUL4AQ13619 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CUL4AQ13619 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CUL4AQ13619 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CUL4AQ13619 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CUL4AQ13619 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CUL4AQ13619 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CUL4AQ13619 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CUL4AQ13619 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CUL4AQ13619 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CUL4AQ13619 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CUL4AQ13619 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CUL4AQ13619 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CUL4AQ13619 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CUL4AQ13619 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CUL4AQ13619 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CUL4AQ13619 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CUL4AQ13619 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CUL4AQ13619 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
CUL4AQ13619 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
CUL4AQ13619 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
CUL4AQ13619 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
CUL4AQ13619 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC26.2■■□□□ 1.78
CUL4AQ13619 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
CUL4AQ13619 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CUL4AQ13619 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CUL4AQ13619 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CUL4AQ13619 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
CUL4AQ13619 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CUL4AQ13619 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
CUL4AQ13619 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CUL4AQ13619 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CUL4AQ13619 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CUL4AQ13619 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CUL4AQ13619 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CUL4AQ13619 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CUL4AQ13619 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CUL4AQ13619 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CUL4AQ13619 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CUL4AQ13619 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CUL4AQ13619 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CUL4AQ13619 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CUL4AQ13619 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CUL4AQ13619 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CUL4AQ13619 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CUL4AQ13619 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CUL4AQ13619 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CUL4AQ13619 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CUL4AQ13619 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CUL4AQ13619 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CUL4AQ13619 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CUL4AQ13619 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CUL4AQ13619 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CUL4AQ13619 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CUL4AQ13619 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CUL4AQ13619 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CUL4AQ13619 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CUL4AQ13619 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CUL4AQ13619 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CUL4AQ13619 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CUL4AQ13619 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CUL4AQ13619 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CUL4AQ13619 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CUL4AQ13619 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CUL4AQ13619 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CUL4AQ13619 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CUL4AQ13619 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CUL4AQ13619 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CUL4AQ13619 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CUL4AQ13619 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CUL4AQ13619 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CUL4AQ13619 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CUL4AQ13619 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CUL4AQ13619 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CUL4AQ13619 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CUL4AQ13619 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CUL4AQ13619 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CUL4AQ13619 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
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