Protein–RNA interactions for Protein: Q12849

GRSF1, G-rich sequence factor 1, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 480 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRSF1Q12849 DDR1-239ENST00000452441 3857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.691e-5■□□□□ 8.9
GRSF1Q12849 DDR1-240ENST00000454612 3942 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.731e-5■□□□□ 8.9
GRSF1Q12849 TRRAP-201ENST00000355540 12590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.241e-5■□□□□ 8.9
GRSF1Q12849 TRRAP-202ENST00000359863 12677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.251e-5■□□□□ 8.9
GRSF1Q12849 TRRAP-207ENST00000628380 12644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.17□□□□□ -1.261e-5■□□□□ 8.9
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GRSF1Q12849 RPL4-212ENST00000566622 817 ntTSL 214.59□□□□□ -0.071e-10■□□□□ 8.8
GRSF1Q12849 RPL4-211ENST00000566491 593 ntTSL 212.8□□□□□ -0.361e-10■□□□□ 8.8
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GRSF1Q12849 RPL4-202ENST00000561554 580 ntTSL 411.85□□□□□ -0.511e-10■□□□□ 8.8
GRSF1Q12849 RPL4-213ENST00000566624 819 ntTSL 211.73□□□□□ -0.531e-10■□□□□ 8.8
GRSF1Q12849 RPL4-217ENST00000569696 569 ntTSL 511.73□□□□□ -0.531e-10■□□□□ 8.8
GRSF1Q12849 RPL4-215ENST00000568588 1864 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.571e-10■□□□□ 8.8
GRSF1Q12849 RPL4-205ENST00000564439 582 ntTSL 311.08□□□□□ -0.641e-10■□□□□ 8.8
GRSF1Q12849 RPL4-201ENST00000307961 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.671e-10■□□□□ 8.8
GRSF1Q12849 RPL4-210ENST00000566039 1099 ntTSL 29.47□□□□□ -0.891e-10■□□□□ 8.8
GRSF1Q12849 RPL4-203ENST00000561775 1396 ntTSL 57.89□□□□□ -1.151e-10■□□□□ 8.8
GRSF1Q12849 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.026e-6■□□□□ 8.8
GRSF1Q12849 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.976e-6■□□□□ 8.8
GRSF1Q12849 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.576e-6■□□□□ 8.8
GRSF1Q12849 ANKHD1-220ENST00000511151 1216 ntTSL 322.99■■□□□ 1.271e-9■□□□□ 8.8
GRSF1Q12849 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.186e-6■□□□□ 8.8
GRSF1Q12849 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.026e-6■□□□□ 8.8
GRSF1Q12849 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.021e-9■□□□□ 8.8
GRSF1Q12849 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.951e-9■□□□□ 8.8
GRSF1Q12849 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.931e-9■□□□□ 8.8
GRSF1Q12849 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.591e-9■□□□□ 8.8
GRSF1Q12849 AKT1-205ENST00000553506 2830 ntTSL 218.57■□□□□ 0.566e-6■□□□□ 8.8
GRSF1Q12849 ANKHD1-207ENST00000421134 4814 ntTSL 517.7■□□□□ 0.421e-9■□□□□ 8.8
GRSF1Q12849 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.421e-9■□□□□ 8.8
GRSF1Q12849 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.291e-9■□□□□ 8.8
GRSF1Q12849 ELL-204ENST00000596915 623 ntTSL 316.86■□□□□ 0.296e-6■□□□□ 8.8
GRSF1Q12849 RASA1-206ENST00000515800 4979 ntTSL 1 (best)16.42■□□□□ 0.226e-6■□□□□ 8.8
GRSF1Q12849 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.226e-6■□□□□ 8.8
GRSF1Q12849 AKT1-218ENST00000557552 8396 ntTSL 516.09■□□□□ 0.176e-6■□□□□ 8.8
GRSF1Q12849 ANKHD1-202ENST00000297183 7606 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.161e-9■□□□□ 8.8
GRSF1Q12849 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.091e-9■□□□□ 8.8
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GRSF1Q12849 L34079.1-201ENST00000594374 393 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.056e-6■□□□□ 8.8
GRSF1Q12849 AKT1-213ENST00000555458 705 ntTSL 215.18■□□□□ 0.026e-6■□□□□ 8.8
GRSF1Q12849 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.016e-6■□□□□ 8.8
GRSF1Q12849 TRIM25-201ENST00000316881 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.116e-6■□□□□ 8.8
GRSF1Q12849 ANKHD1-203ENST00000360839 8221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.161e-9■□□□□ 8.8
GRSF1Q12849 AKT1-219ENST00000610370 3187 ntTSL 213.61□□□□□ -0.236e-6■□□□□ 8.8
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GRSF1Q12849 TRIM25-202ENST00000537230 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.46e-6■□□□□ 8.8
GRSF1Q12849 SDCCAG3-207ENST00000461693 869 ntTSL 212.24□□□□□ -0.456e-6■□□□□ 8.8
GRSF1Q12849 AKT1-208ENST00000554581 3916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.556e-6■□□□□ 8.8
GRSF1Q12849 AKT1-202ENST00000402615 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.686e-6■□□□□ 8.8
GRSF1Q12849 PAH-215ENST00000553106 4122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.866e-6■□□□□ 8.8
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GRSF1Q12849 PAH-213ENST00000551988 584 ntTSL 37.36□□□□□ -1.236e-6■□□□□ 8.8
GRSF1Q12849 ATXN1-210ENST00000498374 1648 ntTSL 1 (best)7.27□□□□□ -1.256e-6■□□□□ 8.8
GRSF1Q12849 ATXN1-205ENST00000479680 568 ntTSL 47.05□□□□□ -1.286e-6■□□□□ 8.8
GRSF1Q12849 PAH-207ENST00000549111 1252 ntTSL 1 (best)6.77□□□□□ -1.336e-6■□□□□ 8.8
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GRSF1Q12849 ATXN1-203ENST00000467008 3362 ntTSL 1 (best)3.43□□□□□ -1.866e-6■□□□□ 8.8
GRSF1Q12849 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.569e-8■□□□□ 8.8
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GRSF1Q12849 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.537e-8■□□□□ 8.8
GRSF1Q12849 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.27e-8■□□□□ 8.8
GRSF1Q12849 VEGFA-215ENST00000497139 2746 ntTSL 1 (best)13.34□□□□□ -0.277e-8■□□□□ 8.8
GRSF1Q12849 VEGFA-212ENST00000480614 12167 ntTSL 1 (best)9.39□□□□□ -0.917e-8■□□□□ 8.8
GRSF1Q12849 SPTBN1-202ENST00000356805 8482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.586e-16■□□□□ 8.7
GRSF1Q12849 SPTBN1-207ENST00000615901 10226 ntTSL 5 BASIC9□□□□□ -0.976e-16■□□□□ 8.7
GRSF1Q12849 SPTBN1-204ENST00000467371 3332 ntTSL 28.18□□□□□ -1.16e-16■□□□□ 8.7
GRSF1Q12849 SLC39A10-204ENST00000418005 563 ntTSL 424.21■■□□□ 1.475e-8■□□□□ 8.7
GRSF1Q12849 SLC39A10-208ENST00000464301 571 ntTSL 415.79■□□□□ 0.125e-8■□□□□ 8.7
GRSF1Q12849 SLC39A10-207ENST00000458054 593 ntTSL 49.84□□□□□ -0.835e-8■□□□□ 8.7
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GRSF1Q12849 SLC39A10-205ENST00000430412 4478 ntTSL 26.05□□□□□ -1.445e-8■□□□□ 8.7
GRSF1Q12849 SLC39A10-206ENST00000444421 544 ntTSL 44.74□□□□□ -1.655e-8■□□□□ 8.7
GRSF1Q12849 SLC39A10-202ENST00000409086 5432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.855e-8■□□□□ 8.7
GRSF1Q12849 SLC39A10-201ENST00000359634 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.935e-8■□□□□ 8.7
GRSF1Q12849 CSTB-202ENST00000480147 2344 nt20.24■□□□□ 0.833e-9■□□□□ 8.7
GRSF1Q12849 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.333e-9■□□□□ 8.7
GRSF1Q12849 CSTB-203ENST00000639959 1855 ntTSL 515.18■□□□□ 0.023e-9■□□□□ 8.7
GRSF1Q12849 CSTB-201ENST00000291568 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.13e-9■□□□□ 8.7
GRSF1Q12849 FUS-211ENST00000568901 521 ntTSL 211.53□□□□□ -0.563e-16■□□□□ 8.7
GRSF1Q12849 EXOC7-211ENST00000465252 3336 ntTSL 213.08□□□□□ -0.313e-7■□□□□ 8.7
GRSF1Q12849 EXOC7-216ENST00000589210 4751 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.473e-7■□□□□ 8.7
GRSF1Q12849 EXOC7-218ENST00000591724 353 ntTSL 511.56□□□□□ -0.563e-7■□□□□ 8.7
GRSF1Q12849 EXOC7-201ENST00000332065 4596 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.63e-7■□□□□ 8.7
GRSF1Q12849 CCDC85C-207ENST00000557769 3793 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.719e-11■□□□□ 8.7
GRSF1Q12849 CCDC85C-201ENST00000380243 16393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.749e-11■□□□□ 8.7
GRSF1Q12849 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC29.33■■■□□ 2.296e-8■□□□□ 8.6
GRSF1Q12849 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.266e-8■□□□□ 8.6
GRSF1Q12849 RAB43-206ENST00000457077 574 ntTSL 419.25■□□□□ 0.676e-8■□□□□ 8.6
GRSF1Q12849 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.46e-8■□□□□ 8.6
GRSF1Q12849 RAB43-202ENST00000393304 4230 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.95□□□□□ -0.186e-8■□□□□ 8.6
GRSF1Q12849 ISY1-RAB43-201ENST00000418265 4868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.246e-8■□□□□ 8.6
GRSF1Q12849 RAB43-203ENST00000393305 4215 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.94□□□□□ -0.346e-8■□□□□ 8.6
GRSF1Q12849 RAB43-204ENST00000393307 4203 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.7□□□□□ -0.386e-8■□□□□ 8.6
GRSF1Q12849 RAB43-205ENST00000393308 4193 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.16□□□□□ -0.466e-8■□□□□ 8.6
GRSF1Q12849 PQLC1-212ENST00000590895 865 ntTSL 318.05■□□□□ 0.481e-14■□□□□ 8.6
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