Protein–RNA interactions for Protein: Q05A80

Caprin2, Caprin-2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,031 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Caprin2Q05A80 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Caprin2Q05A80 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Caprin2Q05A80 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Caprin2Q05A80 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Caprin2Q05A80 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Caprin2Q05A80 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Caprin2Q05A80 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Caprin2Q05A80 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Caprin2Q05A80 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Caprin2Q05A80 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Caprin2Q05A80 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Caprin2Q05A80 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Caprin2Q05A80 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Caprin2Q05A80 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Caprin2Q05A80 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Caprin2Q05A80 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Caprin2Q05A80 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Caprin2Q05A80 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Caprin2Q05A80 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Caprin2Q05A80 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Caprin2Q05A80 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Caprin2Q05A80 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Caprin2Q05A80 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Caprin2Q05A80 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Caprin2Q05A80 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Caprin2Q05A80 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Caprin2Q05A80 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Caprin2Q05A80 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Caprin2Q05A80 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Caprin2Q05A80 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Caprin2Q05A80 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
Caprin2Q05A80 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Caprin2Q05A80 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Caprin2Q05A80 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Caprin2Q05A80 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Caprin2Q05A80 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Caprin2Q05A80 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Caprin2Q05A80 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Caprin2Q05A80 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Caprin2Q05A80 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Caprin2Q05A80 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Caprin2Q05A80 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Caprin2Q05A80 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Caprin2Q05A80 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Caprin2Q05A80 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Caprin2Q05A80 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Caprin2Q05A80 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Caprin2Q05A80 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Caprin2Q05A80 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Caprin2Q05A80 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Caprin2Q05A80 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Caprin2Q05A80 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Caprin2Q05A80 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Caprin2Q05A80 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Caprin2Q05A80 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Caprin2Q05A80 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Caprin2Q05A80 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Caprin2Q05A80 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Caprin2Q05A80 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Caprin2Q05A80 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Caprin2Q05A80 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Caprin2Q05A80 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Caprin2Q05A80 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Caprin2Q05A80 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Caprin2Q05A80 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Caprin2Q05A80 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Caprin2Q05A80 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Caprin2Q05A80 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Caprin2Q05A80 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Caprin2Q05A80 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Caprin2Q05A80 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Caprin2Q05A80 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Caprin2Q05A80 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Caprin2Q05A80 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Caprin2Q05A80 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Caprin2Q05A80 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Caprin2Q05A80 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Caprin2Q05A80 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Caprin2Q05A80 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Caprin2Q05A80 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Caprin2Q05A80 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Caprin2Q05A80 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Caprin2Q05A80 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Caprin2Q05A80 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Caprin2Q05A80 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Caprin2Q05A80 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Caprin2Q05A80 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Caprin2Q05A80 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Caprin2Q05A80 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Caprin2Q05A80 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Caprin2Q05A80 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Caprin2Q05A80 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Caprin2Q05A80 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Caprin2Q05A80 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Caprin2Q05A80 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Caprin2Q05A80 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Caprin2Q05A80 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Caprin2Q05A80 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Caprin2Q05A80 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Caprin2Q05A80 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms