Protein–RNA interactions for Protein: Q03137

Epha4, Ephrin type-A receptor 4, mousemouse

Predictions only

Length 986 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Epha4Q03137 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Epha4Q03137 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Epha4Q03137 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Epha4Q03137 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Epha4Q03137 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Epha4Q03137 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Epha4Q03137 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Epha4Q03137 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Epha4Q03137 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Epha4Q03137 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Epha4Q03137 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Epha4Q03137 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Epha4Q03137 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Epha4Q03137 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Epha4Q03137 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
Epha4Q03137 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Epha4Q03137 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Epha4Q03137 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Epha4Q03137 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Epha4Q03137 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Epha4Q03137 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Epha4Q03137 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Epha4Q03137 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Epha4Q03137 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Epha4Q03137 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Epha4Q03137 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Epha4Q03137 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Epha4Q03137 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Epha4Q03137 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Epha4Q03137 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Epha4Q03137 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Epha4Q03137 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Epha4Q03137 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Epha4Q03137 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Epha4Q03137 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Epha4Q03137 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Epha4Q03137 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Epha4Q03137 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Epha4Q03137 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Epha4Q03137 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Epha4Q03137 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Epha4Q03137 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Epha4Q03137 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Epha4Q03137 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Epha4Q03137 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Epha4Q03137 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Epha4Q03137 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Epha4Q03137 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Epha4Q03137 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Epha4Q03137 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Epha4Q03137 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Epha4Q03137 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Epha4Q03137 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Epha4Q03137 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Epha4Q03137 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Epha4Q03137 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Epha4Q03137 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Epha4Q03137 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Epha4Q03137 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Epha4Q03137 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Epha4Q03137 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Epha4Q03137 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Epha4Q03137 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Epha4Q03137 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Epha4Q03137 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Epha4Q03137 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Epha4Q03137 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Epha4Q03137 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Epha4Q03137 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Epha4Q03137 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Epha4Q03137 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Epha4Q03137 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Epha4Q03137 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Epha4Q03137 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Epha4Q03137 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Epha4Q03137 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Epha4Q03137 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Epha4Q03137 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Epha4Q03137 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Epha4Q03137 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Epha4Q03137 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Epha4Q03137 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Epha4Q03137 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Epha4Q03137 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Epha4Q03137 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Epha4Q03137 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Epha4Q03137 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Epha4Q03137 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Epha4Q03137 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Epha4Q03137 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Epha4Q03137 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Epha4Q03137 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Epha4Q03137 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Epha4Q03137 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Epha4Q03137 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Epha4Q03137 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Epha4Q03137 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Epha4Q03137 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Epha4Q03137 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Epha4Q03137 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms