Protein–RNA interactions for Protein: Q02410

APBA1, Amyloid-beta A4 precursor protein-binding family A member 1, humanhuman

Predictions only

Length 837 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APBA1Q02410 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
APBA1Q02410 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
APBA1Q02410 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
APBA1Q02410 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
APBA1Q02410 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
APBA1Q02410 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
APBA1Q02410 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
APBA1Q02410 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
APBA1Q02410 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
APBA1Q02410 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
APBA1Q02410 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
APBA1Q02410 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
APBA1Q02410 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
APBA1Q02410 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
APBA1Q02410 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
APBA1Q02410 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
APBA1Q02410 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
APBA1Q02410 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
APBA1Q02410 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
APBA1Q02410 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
APBA1Q02410 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
APBA1Q02410 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
APBA1Q02410 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
APBA1Q02410 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
APBA1Q02410 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
APBA1Q02410 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
APBA1Q02410 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
APBA1Q02410 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
APBA1Q02410 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
APBA1Q02410 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
APBA1Q02410 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
APBA1Q02410 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
APBA1Q02410 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
APBA1Q02410 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
APBA1Q02410 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
APBA1Q02410 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
APBA1Q02410 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
APBA1Q02410 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
APBA1Q02410 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
APBA1Q02410 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
APBA1Q02410 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
APBA1Q02410 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
APBA1Q02410 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
APBA1Q02410 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
APBA1Q02410 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
APBA1Q02410 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
APBA1Q02410 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
APBA1Q02410 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
APBA1Q02410 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
APBA1Q02410 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
APBA1Q02410 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
APBA1Q02410 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
APBA1Q02410 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
APBA1Q02410 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
APBA1Q02410 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
APBA1Q02410 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
APBA1Q02410 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
APBA1Q02410 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
APBA1Q02410 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
APBA1Q02410 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
APBA1Q02410 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
APBA1Q02410 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
APBA1Q02410 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
APBA1Q02410 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
APBA1Q02410 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
APBA1Q02410 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
APBA1Q02410 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
APBA1Q02410 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
APBA1Q02410 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
APBA1Q02410 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
APBA1Q02410 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
APBA1Q02410 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
APBA1Q02410 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
APBA1Q02410 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
APBA1Q02410 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
APBA1Q02410 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
APBA1Q02410 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
APBA1Q02410 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
APBA1Q02410 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
APBA1Q02410 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
APBA1Q02410 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
APBA1Q02410 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
APBA1Q02410 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
APBA1Q02410 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
APBA1Q02410 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
APBA1Q02410 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
APBA1Q02410 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
APBA1Q02410 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
APBA1Q02410 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
APBA1Q02410 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
APBA1Q02410 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
APBA1Q02410 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
APBA1Q02410 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
APBA1Q02410 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
APBA1Q02410 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
APBA1Q02410 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
APBA1Q02410 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
APBA1Q02410 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
APBA1Q02410 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
APBA1Q02410 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms