Protein–RNA interactions for Protein: P98194

ATP2C1, Calcium-transporting ATPase type 2C member 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2C1P98194 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ATP2C1P98194 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ATP2C1P98194 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ATP2C1P98194 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ATP2C1P98194 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
ATP2C1P98194 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ATP2C1P98194 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ATP2C1P98194 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ATP2C1P98194 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ATP2C1P98194 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ATP2C1P98194 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ATP2C1P98194 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
ATP2C1P98194 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ATP2C1P98194 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ATP2C1P98194 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ATP2C1P98194 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ATP2C1P98194 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ATP2C1P98194 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ATP2C1P98194 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ATP2C1P98194 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ATP2C1P98194 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ATP2C1P98194 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ATP2C1P98194 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ATP2C1P98194 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ATP2C1P98194 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ATP2C1P98194 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ATP2C1P98194 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ATP2C1P98194 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ATP2C1P98194 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
ATP2C1P98194 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ATP2C1P98194 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ATP2C1P98194 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ATP2C1P98194 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ATP2C1P98194 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ATP2C1P98194 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ATP2C1P98194 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ATP2C1P98194 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ATP2C1P98194 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ATP2C1P98194 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ATP2C1P98194 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
ATP2C1P98194 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ATP2C1P98194 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ATP2C1P98194 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ATP2C1P98194 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ATP2C1P98194 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ATP2C1P98194 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ATP2C1P98194 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ATP2C1P98194 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ATP2C1P98194 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ATP2C1P98194 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ATP2C1P98194 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ATP2C1P98194 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ATP2C1P98194 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ATP2C1P98194 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ATP2C1P98194 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ATP2C1P98194 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ATP2C1P98194 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ATP2C1P98194 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ATP2C1P98194 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ATP2C1P98194 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
ATP2C1P98194 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
ATP2C1P98194 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ATP2C1P98194 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ATP2C1P98194 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ATP2C1P98194 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ATP2C1P98194 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ATP2C1P98194 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ATP2C1P98194 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ATP2C1P98194 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ATP2C1P98194 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ATP2C1P98194 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ATP2C1P98194 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ATP2C1P98194 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ATP2C1P98194 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ATP2C1P98194 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ATP2C1P98194 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ATP2C1P98194 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ATP2C1P98194 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ATP2C1P98194 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ATP2C1P98194 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ATP2C1P98194 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ATP2C1P98194 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ATP2C1P98194 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ATP2C1P98194 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ATP2C1P98194 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
ATP2C1P98194 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
ATP2C1P98194 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ATP2C1P98194 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
ATP2C1P98194 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ATP2C1P98194 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
ATP2C1P98194 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
ATP2C1P98194 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ATP2C1P98194 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ATP2C1P98194 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ATP2C1P98194 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ATP2C1P98194 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ATP2C1P98194 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ATP2C1P98194 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ATP2C1P98194 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
ATP2C1P98194 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 133.8 ms