Protein–RNA interactions for Protein: P98156

Vldlr, Very low-density lipoprotein receptor, mousemouse

Predictions only

Length 873 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VldlrP98156 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
VldlrP98156 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
VldlrP98156 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
VldlrP98156 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
VldlrP98156 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
VldlrP98156 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
VldlrP98156 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
VldlrP98156 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
VldlrP98156 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
VldlrP98156 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
VldlrP98156 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
VldlrP98156 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
VldlrP98156 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
VldlrP98156 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
VldlrP98156 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
VldlrP98156 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
VldlrP98156 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
VldlrP98156 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
VldlrP98156 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
VldlrP98156 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
VldlrP98156 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
VldlrP98156 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
VldlrP98156 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
VldlrP98156 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
VldlrP98156 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
VldlrP98156 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
VldlrP98156 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
VldlrP98156 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
VldlrP98156 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
VldlrP98156 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
VldlrP98156 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
VldlrP98156 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
VldlrP98156 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
VldlrP98156 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
VldlrP98156 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
VldlrP98156 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
VldlrP98156 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC18.82■□□□□ 0.6
VldlrP98156 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
VldlrP98156 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
VldlrP98156 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
VldlrP98156 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
VldlrP98156 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
VldlrP98156 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
VldlrP98156 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
VldlrP98156 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
VldlrP98156 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
VldlrP98156 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
VldlrP98156 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
VldlrP98156 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
VldlrP98156 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
VldlrP98156 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
VldlrP98156 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
VldlrP98156 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
VldlrP98156 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
VldlrP98156 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
VldlrP98156 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
VldlrP98156 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
VldlrP98156 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
VldlrP98156 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
VldlrP98156 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
VldlrP98156 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
VldlrP98156 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
VldlrP98156 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC18.8■□□□□ 0.6
VldlrP98156 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
VldlrP98156 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
VldlrP98156 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
VldlrP98156 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
VldlrP98156 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
VldlrP98156 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
VldlrP98156 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
VldlrP98156 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
VldlrP98156 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
VldlrP98156 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
VldlrP98156 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
VldlrP98156 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
VldlrP98156 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
VldlrP98156 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
VldlrP98156 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
VldlrP98156 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
VldlrP98156 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
VldlrP98156 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
VldlrP98156 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
VldlrP98156 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
VldlrP98156 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
VldlrP98156 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
VldlrP98156 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
VldlrP98156 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
VldlrP98156 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
VldlrP98156 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
VldlrP98156 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
VldlrP98156 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
VldlrP98156 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
VldlrP98156 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
VldlrP98156 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
VldlrP98156 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
VldlrP98156 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
VldlrP98156 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
VldlrP98156 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
VldlrP98156 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
VldlrP98156 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.8 ms