Protein–RNA interactions for Protein: P70298

Cux2, Homeobox protein cut-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,426 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cux2P70298 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC33.45■■■□□ 2.95
Cux2P70298 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
Cux2P70298 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
Cux2P70298 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
Cux2P70298 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
Cux2P70298 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.94
Cux2P70298 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
Cux2P70298 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC33.44■■■□□ 2.94
Cux2P70298 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
Cux2P70298 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
Cux2P70298 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC33.43■■■□□ 2.94
Cux2P70298 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
Cux2P70298 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC33.43■■■□□ 2.94
Cux2P70298 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
Cux2P70298 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
Cux2P70298 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC33.42■■■□□ 2.94
Cux2P70298 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
Cux2P70298 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
Cux2P70298 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
Cux2P70298 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC33.41■■■□□ 2.94
Cux2P70298 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC33.41■■■□□ 2.94
Cux2P70298 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC33.41■■■□□ 2.94
Cux2P70298 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
Cux2P70298 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
Cux2P70298 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC33.41■■■□□ 2.94
Cux2P70298 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC33.4■■■□□ 2.94
Cux2P70298 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
Cux2P70298 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
Cux2P70298 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
Cux2P70298 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
Cux2P70298 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC33.39■■■□□ 2.94
Cux2P70298 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC33.39■■■□□ 2.94
Cux2P70298 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC33.39■■■□□ 2.94
Cux2P70298 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
Cux2P70298 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.39■■■□□ 2.94
Cux2P70298 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
Cux2P70298 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.38■■■□□ 2.93
Cux2P70298 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
Cux2P70298 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC33.38■■■□□ 2.93
Cux2P70298 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC33.38■■■□□ 2.93
Cux2P70298 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC33.38■■■□□ 2.93
Cux2P70298 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
Cux2P70298 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
Cux2P70298 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC33.38■■■□□ 2.93
Cux2P70298 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
Cux2P70298 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
Cux2P70298 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
Cux2P70298 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.37■■■□□ 2.93
Cux2P70298 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
Cux2P70298 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.36■■■□□ 2.93
Cux2P70298 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
Cux2P70298 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.36■■■□□ 2.93
Cux2P70298 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
Cux2P70298 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
Cux2P70298 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC33.36■■■□□ 2.93
Cux2P70298 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
Cux2P70298 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
Cux2P70298 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.35■■■□□ 2.93
Cux2P70298 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC33.35■■■□□ 2.93
Cux2P70298 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC33.35■■■□□ 2.93
Cux2P70298 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC33.35■■■□□ 2.93
Cux2P70298 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
Cux2P70298 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.34■■■□□ 2.93
Cux2P70298 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
Cux2P70298 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
Cux2P70298 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC33.34■■■□□ 2.93
Cux2P70298 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
Cux2P70298 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
Cux2P70298 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
Cux2P70298 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.93
Cux2P70298 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
Cux2P70298 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
Cux2P70298 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
Cux2P70298 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
Cux2P70298 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
Cux2P70298 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
Cux2P70298 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
Cux2P70298 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
Cux2P70298 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
Cux2P70298 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
Cux2P70298 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
Cux2P70298 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
Cux2P70298 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
Cux2P70298 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC33.3■■■□□ 2.92
Cux2P70298 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
Cux2P70298 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
Cux2P70298 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
Cux2P70298 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC33.29■■■□□ 2.92
Cux2P70298 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
Cux2P70298 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
Cux2P70298 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
Cux2P70298 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
Cux2P70298 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
Cux2P70298 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
Cux2P70298 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC33.28■■■□□ 2.92
Cux2P70298 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC33.28■■■□□ 2.92
Cux2P70298 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC33.28■■■□□ 2.92
Cux2P70298 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
Cux2P70298 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
Cux2P70298 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.3 ms