Protein–RNA interactions for Protein: P62281

Rps11, 40S ribosomal protein S11, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 158 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps11P62281 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rps11P62281 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rps11P62281 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Rps11P62281 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rps11P62281 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rps11P62281 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rps11P62281 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rps11P62281 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rps11P62281 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rps11P62281 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rps11P62281 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Rps11P62281 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rps11P62281 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rps11P62281 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rps11P62281 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rps11P62281 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rps11P62281 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rps11P62281 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rps11P62281 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rps11P62281 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rps11P62281 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rps11P62281 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rps11P62281 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rps11P62281 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rps11P62281 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rps11P62281 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Rps11P62281 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rps11P62281 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rps11P62281 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rps11P62281 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rps11P62281 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rps11P62281 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rps11P62281 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rps11P62281 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rps11P62281 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rps11P62281 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rps11P62281 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rps11P62281 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rps11P62281 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rps11P62281 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rps11P62281 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rps11P62281 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rps11P62281 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rps11P62281 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rps11P62281 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rps11P62281 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rps11P62281 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rps11P62281 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Rps11P62281 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rps11P62281 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rps11P62281 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rps11P62281 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rps11P62281 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rps11P62281 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rps11P62281 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rps11P62281 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rps11P62281 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rps11P62281 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rps11P62281 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Rps11P62281 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rps11P62281 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rps11P62281 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rps11P62281 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rps11P62281 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rps11P62281 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rps11P62281 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rps11P62281 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rps11P62281 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rps11P62281 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rps11P62281 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rps11P62281 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rps11P62281 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rps11P62281 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rps11P62281 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rps11P62281 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rps11P62281 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rps11P62281 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rps11P62281 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rps11P62281 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rps11P62281 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rps11P62281 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rps11P62281 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rps11P62281 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rps11P62281 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Rps11P62281 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rps11P62281 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rps11P62281 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rps11P62281 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rps11P62281 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Rps11P62281 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rps11P62281 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Rps11P62281 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rps11P62281 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rps11P62281 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rps11P62281 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rps11P62281 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rps11P62281 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rps11P62281 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rps11P62281 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rps11P62281 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17 ms