Protein–RNA interactions for Protein: P57740

NUP107, Nuclear pore complex protein Nup107, humanhuman

Predictions only

Length 925 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP107P57740 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NUP107P57740 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
NUP107P57740 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NUP107P57740 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NUP107P57740 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.99
NUP107P57740 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
NUP107P57740 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
NUP107P57740 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
NUP107P57740 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
NUP107P57740 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
NUP107P57740 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
NUP107P57740 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
NUP107P57740 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
NUP107P57740 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
NUP107P57740 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
NUP107P57740 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
NUP107P57740 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
NUP107P57740 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
NUP107P57740 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
NUP107P57740 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
NUP107P57740 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
NUP107P57740 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
NUP107P57740 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
NUP107P57740 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
NUP107P57740 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
NUP107P57740 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
NUP107P57740 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
NUP107P57740 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
NUP107P57740 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC21.18■□□□□ 0.98
NUP107P57740 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC21.18■□□□□ 0.98
NUP107P57740 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
NUP107P57740 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
NUP107P57740 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
NUP107P57740 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
NUP107P57740 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
NUP107P57740 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
NUP107P57740 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
NUP107P57740 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
NUP107P57740 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
NUP107P57740 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
NUP107P57740 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC21.17■□□□□ 0.98
NUP107P57740 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
NUP107P57740 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
NUP107P57740 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
NUP107P57740 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
NUP107P57740 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
NUP107P57740 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
NUP107P57740 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
NUP107P57740 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
NUP107P57740 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
NUP107P57740 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
NUP107P57740 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
NUP107P57740 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
NUP107P57740 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
NUP107P57740 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
NUP107P57740 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
NUP107P57740 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
NUP107P57740 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
NUP107P57740 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
NUP107P57740 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
NUP107P57740 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
NUP107P57740 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
NUP107P57740 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
NUP107P57740 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC21.16■□□□□ 0.98
NUP107P57740 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
NUP107P57740 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
NUP107P57740 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
NUP107P57740 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
NUP107P57740 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
NUP107P57740 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
NUP107P57740 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
NUP107P57740 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
NUP107P57740 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
NUP107P57740 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
NUP107P57740 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
NUP107P57740 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
NUP107P57740 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
NUP107P57740 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
NUP107P57740 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
NUP107P57740 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
NUP107P57740 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
NUP107P57740 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
NUP107P57740 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
NUP107P57740 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
NUP107P57740 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
NUP107P57740 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
NUP107P57740 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
NUP107P57740 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
NUP107P57740 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
NUP107P57740 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
NUP107P57740 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
NUP107P57740 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
NUP107P57740 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NUP107P57740 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NUP107P57740 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NUP107P57740 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NUP107P57740 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
NUP107P57740 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NUP107P57740 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
NUP107P57740 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.2 ms