Protein–RNA interactions for Protein: P55075

FGF8, Fibroblast growth factor 8, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGF8P55075 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
FGF8P55075 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
FGF8P55075 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
FGF8P55075 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
FGF8P55075 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
FGF8P55075 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
FGF8P55075 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
FGF8P55075 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
FGF8P55075 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
FGF8P55075 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
FGF8P55075 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
FGF8P55075 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
FGF8P55075 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
FGF8P55075 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
FGF8P55075 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
FGF8P55075 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
FGF8P55075 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
FGF8P55075 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
FGF8P55075 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
FGF8P55075 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
FGF8P55075 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
FGF8P55075 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
FGF8P55075 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
FGF8P55075 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
FGF8P55075 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
FGF8P55075 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
FGF8P55075 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
FGF8P55075 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
FGF8P55075 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
FGF8P55075 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
FGF8P55075 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
FGF8P55075 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
FGF8P55075 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
FGF8P55075 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
FGF8P55075 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
FGF8P55075 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
FGF8P55075 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
FGF8P55075 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
FGF8P55075 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
FGF8P55075 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
FGF8P55075 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
FGF8P55075 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
FGF8P55075 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
FGF8P55075 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
FGF8P55075 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
FGF8P55075 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
FGF8P55075 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC17.6■□□□□ 0.41
FGF8P55075 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
FGF8P55075 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
FGF8P55075 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
FGF8P55075 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
FGF8P55075 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC17.6■□□□□ 0.41
FGF8P55075 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
FGF8P55075 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
FGF8P55075 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
FGF8P55075 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
FGF8P55075 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
FGF8P55075 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
FGF8P55075 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC17.59■□□□□ 0.41
FGF8P55075 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
FGF8P55075 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
FGF8P55075 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
FGF8P55075 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
FGF8P55075 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
FGF8P55075 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
FGF8P55075 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
FGF8P55075 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
FGF8P55075 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
FGF8P55075 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
FGF8P55075 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
FGF8P55075 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
FGF8P55075 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
FGF8P55075 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
FGF8P55075 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
FGF8P55075 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
FGF8P55075 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
FGF8P55075 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
FGF8P55075 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
FGF8P55075 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
FGF8P55075 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
FGF8P55075 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
FGF8P55075 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
FGF8P55075 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
FGF8P55075 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
FGF8P55075 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
FGF8P55075 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
FGF8P55075 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
FGF8P55075 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
FGF8P55075 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
FGF8P55075 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
FGF8P55075 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
FGF8P55075 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
FGF8P55075 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
FGF8P55075 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
FGF8P55075 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
FGF8P55075 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
FGF8P55075 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
FGF8P55075 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
FGF8P55075 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
FGF8P55075 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.9 ms