Protein–RNA interactions for Protein: P49769

Psen1, Presenilin-1, mousemouse

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psen1P49769 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Psen1P49769 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Psen1P49769 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Psen1P49769 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Psen1P49769 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Psen1P49769 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Psen1P49769 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Psen1P49769 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Psen1P49769 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Psen1P49769 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Psen1P49769 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Psen1P49769 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Psen1P49769 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Psen1P49769 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Psen1P49769 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Psen1P49769 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Psen1P49769 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Psen1P49769 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Psen1P49769 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Psen1P49769 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Psen1P49769 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Psen1P49769 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Psen1P49769 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Psen1P49769 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Psen1P49769 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Psen1P49769 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Psen1P49769 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Psen1P49769 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Psen1P49769 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Psen1P49769 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Psen1P49769 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Psen1P49769 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Psen1P49769 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Psen1P49769 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Psen1P49769 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Psen1P49769 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Psen1P49769 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Psen1P49769 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Psen1P49769 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Psen1P49769 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Psen1P49769 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Psen1P49769 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Psen1P49769 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Psen1P49769 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Psen1P49769 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Psen1P49769 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Psen1P49769 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Psen1P49769 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Psen1P49769 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Psen1P49769 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Psen1P49769 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Psen1P49769 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Psen1P49769 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Psen1P49769 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Psen1P49769 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Psen1P49769 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Psen1P49769 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Psen1P49769 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Psen1P49769 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Psen1P49769 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Psen1P49769 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Psen1P49769 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Psen1P49769 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Psen1P49769 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Psen1P49769 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Psen1P49769 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Psen1P49769 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Psen1P49769 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Psen1P49769 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Psen1P49769 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Psen1P49769 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Psen1P49769 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Psen1P49769 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Psen1P49769 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Psen1P49769 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Psen1P49769 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Psen1P49769 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Psen1P49769 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Psen1P49769 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Psen1P49769 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Psen1P49769 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Psen1P49769 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Psen1P49769 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Psen1P49769 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Psen1P49769 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Psen1P49769 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Psen1P49769 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Psen1P49769 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Psen1P49769 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Psen1P49769 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Psen1P49769 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Psen1P49769 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Psen1P49769 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Psen1P49769 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Psen1P49769 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Psen1P49769 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Psen1P49769 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Psen1P49769 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Psen1P49769 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Psen1P49769 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 123.1 ms