Protein–RNA interactions for Protein: P48776

Tdo2, Tryptophan 2,3-dioxygenase, mousemouse

Predictions only

Length 406 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tdo2P48776 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tdo2P48776 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tdo2P48776 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tdo2P48776 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tdo2P48776 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tdo2P48776 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tdo2P48776 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tdo2P48776 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tdo2P48776 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tdo2P48776 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tdo2P48776 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tdo2P48776 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tdo2P48776 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tdo2P48776 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tdo2P48776 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tdo2P48776 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tdo2P48776 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tdo2P48776 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tdo2P48776 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tdo2P48776 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tdo2P48776 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tdo2P48776 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tdo2P48776 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Tdo2P48776 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tdo2P48776 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tdo2P48776 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tdo2P48776 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tdo2P48776 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tdo2P48776 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tdo2P48776 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tdo2P48776 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tdo2P48776 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tdo2P48776 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tdo2P48776 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tdo2P48776 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tdo2P48776 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tdo2P48776 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tdo2P48776 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Tdo2P48776 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tdo2P48776 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tdo2P48776 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tdo2P48776 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tdo2P48776 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tdo2P48776 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tdo2P48776 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tdo2P48776 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tdo2P48776 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tdo2P48776 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tdo2P48776 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tdo2P48776 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tdo2P48776 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tdo2P48776 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tdo2P48776 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tdo2P48776 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tdo2P48776 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tdo2P48776 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tdo2P48776 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tdo2P48776 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tdo2P48776 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tdo2P48776 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tdo2P48776 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tdo2P48776 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tdo2P48776 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tdo2P48776 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tdo2P48776 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tdo2P48776 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tdo2P48776 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tdo2P48776 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tdo2P48776 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tdo2P48776 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tdo2P48776 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Tdo2P48776 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Tdo2P48776 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tdo2P48776 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tdo2P48776 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tdo2P48776 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tdo2P48776 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tdo2P48776 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tdo2P48776 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tdo2P48776 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tdo2P48776 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tdo2P48776 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tdo2P48776 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tdo2P48776 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Tdo2P48776 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tdo2P48776 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tdo2P48776 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tdo2P48776 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tdo2P48776 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tdo2P48776 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tdo2P48776 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tdo2P48776 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tdo2P48776 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tdo2P48776 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tdo2P48776 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tdo2P48776 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tdo2P48776 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tdo2P48776 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Tdo2P48776 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tdo2P48776 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.9 ms