Protein–RNA interactions for Protein: P46471

Psmc2, 26S proteasome regulatory subunit 7, mousemouse

Predictions only

Length 433 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmc2P46471 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Psmc2P46471 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Psmc2P46471 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Psmc2P46471 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Psmc2P46471 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Psmc2P46471 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Psmc2P46471 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Psmc2P46471 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Psmc2P46471 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Psmc2P46471 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Psmc2P46471 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Psmc2P46471 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Psmc2P46471 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Psmc2P46471 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Psmc2P46471 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Psmc2P46471 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Psmc2P46471 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Psmc2P46471 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Psmc2P46471 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Psmc2P46471 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Psmc2P46471 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Psmc2P46471 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Psmc2P46471 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Psmc2P46471 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Psmc2P46471 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Psmc2P46471 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Psmc2P46471 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Psmc2P46471 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Psmc2P46471 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Psmc2P46471 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Psmc2P46471 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Psmc2P46471 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Psmc2P46471 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Psmc2P46471 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Psmc2P46471 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Psmc2P46471 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Psmc2P46471 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Psmc2P46471 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Psmc2P46471 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Psmc2P46471 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Psmc2P46471 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Psmc2P46471 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Psmc2P46471 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Psmc2P46471 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Psmc2P46471 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Psmc2P46471 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Psmc2P46471 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Psmc2P46471 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Psmc2P46471 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Psmc2P46471 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Psmc2P46471 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Psmc2P46471 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Psmc2P46471 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Psmc2P46471 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Psmc2P46471 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Psmc2P46471 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Psmc2P46471 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Psmc2P46471 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Psmc2P46471 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Psmc2P46471 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Psmc2P46471 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Psmc2P46471 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Psmc2P46471 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Psmc2P46471 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Psmc2P46471 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Psmc2P46471 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Psmc2P46471 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Psmc2P46471 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Psmc2P46471 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Psmc2P46471 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Psmc2P46471 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Psmc2P46471 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Psmc2P46471 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Psmc2P46471 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Psmc2P46471 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Psmc2P46471 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Psmc2P46471 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Psmc2P46471 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Psmc2P46471 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Psmc2P46471 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Psmc2P46471 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Psmc2P46471 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Psmc2P46471 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Psmc2P46471 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Psmc2P46471 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Psmc2P46471 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Psmc2P46471 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Psmc2P46471 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Psmc2P46471 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Psmc2P46471 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Psmc2P46471 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Psmc2P46471 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Psmc2P46471 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Psmc2P46471 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Psmc2P46471 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Psmc2P46471 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Psmc2P46471 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Psmc2P46471 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Psmc2P46471 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Psmc2P46471 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.2 ms