Protein–RNA interactions for Protein: P46414

Cdkn1b, Cyclin-dependent kinase inhibitor 1B, mousemouse

Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkn1bP46414 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cdkn1bP46414 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Cdkn1bP46414 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cdkn1bP46414 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cdkn1bP46414 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cdkn1bP46414 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cdkn1bP46414 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cdkn1bP46414 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cdkn1bP46414 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cdkn1bP46414 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cdkn1bP46414 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cdkn1bP46414 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cdkn1bP46414 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC16.83■□□□□ 0.29
Cdkn1bP46414 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Cdkn1bP46414 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
Cdkn1bP46414 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cdkn1bP46414 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Cdkn1bP46414 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cdkn1bP46414 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Cdkn1bP46414 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Cdkn1bP46414 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cdkn1bP46414 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cdkn1bP46414 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cdkn1bP46414 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cdkn1bP46414 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cdkn1bP46414 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Cdkn1bP46414 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cdkn1bP46414 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cdkn1bP46414 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cdkn1bP46414 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cdkn1bP46414 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cdkn1bP46414 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cdkn1bP46414 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cdkn1bP46414 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cdkn1bP46414 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cdkn1bP46414 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cdkn1bP46414 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cdkn1bP46414 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cdkn1bP46414 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cdkn1bP46414 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cdkn1bP46414 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cdkn1bP46414 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cdkn1bP46414 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cdkn1bP46414 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cdkn1bP46414 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cdkn1bP46414 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Cdkn1bP46414 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cdkn1bP46414 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cdkn1bP46414 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cdkn1bP46414 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cdkn1bP46414 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cdkn1bP46414 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cdkn1bP46414 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cdkn1bP46414 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cdkn1bP46414 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cdkn1bP46414 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cdkn1bP46414 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cdkn1bP46414 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cdkn1bP46414 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cdkn1bP46414 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Cdkn1bP46414 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cdkn1bP46414 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cdkn1bP46414 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cdkn1bP46414 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cdkn1bP46414 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cdkn1bP46414 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cdkn1bP46414 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cdkn1bP46414 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cdkn1bP46414 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cdkn1bP46414 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cdkn1bP46414 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cdkn1bP46414 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cdkn1bP46414 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Cdkn1bP46414 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cdkn1bP46414 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cdkn1bP46414 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cdkn1bP46414 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cdkn1bP46414 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cdkn1bP46414 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Cdkn1bP46414 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cdkn1bP46414 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cdkn1bP46414 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cdkn1bP46414 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cdkn1bP46414 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cdkn1bP46414 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cdkn1bP46414 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cdkn1bP46414 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cdkn1bP46414 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Cdkn1bP46414 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cdkn1bP46414 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cdkn1bP46414 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cdkn1bP46414 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cdkn1bP46414 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Cdkn1bP46414 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cdkn1bP46414 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cdkn1bP46414 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cdkn1bP46414 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Cdkn1bP46414 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Cdkn1bP46414 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Cdkn1bP46414 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms