Protein–RNA interactions for Protein: P46099

Klf1, Krueppel-like factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klf1P46099 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Klf1P46099 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Klf1P46099 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Klf1P46099 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Klf1P46099 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Klf1P46099 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Klf1P46099 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Klf1P46099 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Klf1P46099 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Klf1P46099 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Klf1P46099 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Klf1P46099 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Klf1P46099 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Klf1P46099 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Klf1P46099 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Klf1P46099 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Klf1P46099 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Klf1P46099 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Klf1P46099 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Klf1P46099 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Klf1P46099 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Klf1P46099 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Klf1P46099 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Klf1P46099 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Klf1P46099 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Klf1P46099 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Klf1P46099 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Klf1P46099 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Klf1P46099 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Klf1P46099 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Klf1P46099 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Klf1P46099 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Klf1P46099 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Klf1P46099 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Klf1P46099 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Klf1P46099 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Klf1P46099 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Klf1P46099 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Klf1P46099 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Klf1P46099 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Klf1P46099 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Klf1P46099 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Klf1P46099 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Klf1P46099 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Klf1P46099 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Klf1P46099 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Klf1P46099 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Klf1P46099 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Klf1P46099 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Klf1P46099 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Klf1P46099 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Klf1P46099 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Klf1P46099 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Klf1P46099 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Klf1P46099 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Klf1P46099 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Klf1P46099 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Klf1P46099 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Klf1P46099 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Klf1P46099 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Klf1P46099 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Klf1P46099 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Klf1P46099 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Klf1P46099 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Klf1P46099 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Klf1P46099 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Klf1P46099 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Klf1P46099 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Klf1P46099 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Klf1P46099 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Klf1P46099 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Klf1P46099 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Klf1P46099 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Klf1P46099 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Klf1P46099 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Klf1P46099 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Klf1P46099 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Klf1P46099 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Klf1P46099 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Klf1P46099 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Klf1P46099 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Klf1P46099 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Klf1P46099 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Klf1P46099 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Klf1P46099 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Klf1P46099 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Klf1P46099 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Klf1P46099 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Klf1P46099 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Klf1P46099 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Klf1P46099 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Klf1P46099 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Klf1P46099 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Klf1P46099 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Klf1P46099 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Klf1P46099 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Klf1P46099 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Klf1P46099 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Klf1P46099 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Klf1P46099 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms