Protein–RNA interactions for Protein: P45844

ABCG1, ATP-binding cassette sub-family G member 1, humanhuman

Predictions only

Length 678 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCG1P45844 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ABCG1P45844 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ABCG1P45844 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
ABCG1P45844 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ABCG1P45844 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ABCG1P45844 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ABCG1P45844 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ABCG1P45844 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ABCG1P45844 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ABCG1P45844 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ABCG1P45844 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ABCG1P45844 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ABCG1P45844 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ABCG1P45844 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ABCG1P45844 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ABCG1P45844 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ABCG1P45844 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
ABCG1P45844 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ABCG1P45844 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ABCG1P45844 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ABCG1P45844 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ABCG1P45844 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
ABCG1P45844 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
ABCG1P45844 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ABCG1P45844 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ABCG1P45844 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ABCG1P45844 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ABCG1P45844 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ABCG1P45844 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ABCG1P45844 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ABCG1P45844 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ABCG1P45844 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ABCG1P45844 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ABCG1P45844 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ABCG1P45844 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ABCG1P45844 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ABCG1P45844 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ABCG1P45844 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ABCG1P45844 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ABCG1P45844 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ABCG1P45844 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ABCG1P45844 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
ABCG1P45844 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
ABCG1P45844 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ABCG1P45844 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ABCG1P45844 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ABCG1P45844 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ABCG1P45844 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ABCG1P45844 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ABCG1P45844 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ABCG1P45844 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ABCG1P45844 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ABCG1P45844 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ABCG1P45844 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ABCG1P45844 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ABCG1P45844 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ABCG1P45844 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ABCG1P45844 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ABCG1P45844 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ABCG1P45844 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ABCG1P45844 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ABCG1P45844 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ABCG1P45844 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ABCG1P45844 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ABCG1P45844 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
ABCG1P45844 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ABCG1P45844 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ABCG1P45844 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ABCG1P45844 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ABCG1P45844 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ABCG1P45844 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ABCG1P45844 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ABCG1P45844 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ABCG1P45844 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ABCG1P45844 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ABCG1P45844 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ABCG1P45844 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ABCG1P45844 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ABCG1P45844 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ABCG1P45844 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ABCG1P45844 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ABCG1P45844 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ABCG1P45844 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ABCG1P45844 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ABCG1P45844 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ABCG1P45844 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ABCG1P45844 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ABCG1P45844 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ABCG1P45844 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ABCG1P45844 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ABCG1P45844 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ABCG1P45844 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ABCG1P45844 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ABCG1P45844 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ABCG1P45844 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ABCG1P45844 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ABCG1P45844 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ABCG1P45844 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ABCG1P45844 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ABCG1P45844 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.8 ms