Protein–RNA interactions for Protein: P42581

Hmx3, Homeobox protein HMX3, mousemouse

Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmx3P42581 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hmx3P42581 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hmx3P42581 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hmx3P42581 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hmx3P42581 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hmx3P42581 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hmx3P42581 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hmx3P42581 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hmx3P42581 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hmx3P42581 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hmx3P42581 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hmx3P42581 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hmx3P42581 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hmx3P42581 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hmx3P42581 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hmx3P42581 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hmx3P42581 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hmx3P42581 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hmx3P42581 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hmx3P42581 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hmx3P42581 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hmx3P42581 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hmx3P42581 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hmx3P42581 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hmx3P42581 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hmx3P42581 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hmx3P42581 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hmx3P42581 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hmx3P42581 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hmx3P42581 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hmx3P42581 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hmx3P42581 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hmx3P42581 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hmx3P42581 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hmx3P42581 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hmx3P42581 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hmx3P42581 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hmx3P42581 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hmx3P42581 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hmx3P42581 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hmx3P42581 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hmx3P42581 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hmx3P42581 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hmx3P42581 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hmx3P42581 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hmx3P42581 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Hmx3P42581 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hmx3P42581 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hmx3P42581 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hmx3P42581 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hmx3P42581 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hmx3P42581 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hmx3P42581 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hmx3P42581 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hmx3P42581 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hmx3P42581 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hmx3P42581 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hmx3P42581 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hmx3P42581 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hmx3P42581 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Hmx3P42581 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hmx3P42581 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hmx3P42581 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hmx3P42581 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hmx3P42581 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hmx3P42581 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hmx3P42581 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Hmx3P42581 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hmx3P42581 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hmx3P42581 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hmx3P42581 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hmx3P42581 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hmx3P42581 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hmx3P42581 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hmx3P42581 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hmx3P42581 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hmx3P42581 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hmx3P42581 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hmx3P42581 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hmx3P42581 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hmx3P42581 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hmx3P42581 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hmx3P42581 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hmx3P42581 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hmx3P42581 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hmx3P42581 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hmx3P42581 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Hmx3P42581 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hmx3P42581 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hmx3P42581 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Hmx3P42581 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hmx3P42581 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hmx3P42581 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hmx3P42581 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hmx3P42581 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hmx3P42581 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hmx3P42581 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hmx3P42581 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hmx3P42581 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hmx3P42581 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms