Protein–RNA interactions for Protein: P39059

COL15A1, Collagen alpha-1(XV) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL15A1P39059 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
COL15A1P39059 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
COL15A1P39059 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
COL15A1P39059 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC28.6■■■□□ 2.17
COL15A1P39059 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
COL15A1P39059 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC28.6■■■□□ 2.17
COL15A1P39059 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
COL15A1P39059 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
COL15A1P39059 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC28.6■■■□□ 2.17
COL15A1P39059 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
COL15A1P39059 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
COL15A1P39059 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
COL15A1P39059 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
COL15A1P39059 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
COL15A1P39059 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
COL15A1P39059 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
COL15A1P39059 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
COL15A1P39059 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
COL15A1P39059 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC28.59■■■□□ 2.17
COL15A1P39059 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
COL15A1P39059 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
COL15A1P39059 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
COL15A1P39059 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
COL15A1P39059 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
COL15A1P39059 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
COL15A1P39059 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
COL15A1P39059 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
COL15A1P39059 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
COL15A1P39059 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
COL15A1P39059 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
COL15A1P39059 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
COL15A1P39059 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
COL15A1P39059 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
COL15A1P39059 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
COL15A1P39059 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
COL15A1P39059 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
COL15A1P39059 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
COL15A1P39059 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
COL15A1P39059 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC28.57■■■□□ 2.16
COL15A1P39059 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
COL15A1P39059 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
COL15A1P39059 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
COL15A1P39059 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
COL15A1P39059 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC28.56■■■□□ 2.16
COL15A1P39059 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
COL15A1P39059 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
COL15A1P39059 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
COL15A1P39059 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
COL15A1P39059 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
COL15A1P39059 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
COL15A1P39059 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
COL15A1P39059 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
COL15A1P39059 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
COL15A1P39059 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
COL15A1P39059 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
COL15A1P39059 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
COL15A1P39059 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC28.55■■■□□ 2.16
COL15A1P39059 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
COL15A1P39059 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
COL15A1P39059 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
COL15A1P39059 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
COL15A1P39059 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
COL15A1P39059 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC28.54■■■□□ 2.16
COL15A1P39059 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
COL15A1P39059 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
COL15A1P39059 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
COL15A1P39059 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
COL15A1P39059 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
COL15A1P39059 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
COL15A1P39059 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
COL15A1P39059 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
COL15A1P39059 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
COL15A1P39059 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
COL15A1P39059 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
COL15A1P39059 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC28.53■■■□□ 2.16
COL15A1P39059 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
COL15A1P39059 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
COL15A1P39059 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
COL15A1P39059 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
COL15A1P39059 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
COL15A1P39059 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
COL15A1P39059 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
COL15A1P39059 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
COL15A1P39059 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC28.52■■■□□ 2.16
COL15A1P39059 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
COL15A1P39059 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
COL15A1P39059 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
COL15A1P39059 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.16
COL15A1P39059 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
COL15A1P39059 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
COL15A1P39059 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
COL15A1P39059 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
COL15A1P39059 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
COL15A1P39059 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
COL15A1P39059 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
COL15A1P39059 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
COL15A1P39059 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
COL15A1P39059 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
COL15A1P39059 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
COL15A1P39059 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 101.5 ms