Protein–RNA interactions for Protein: P38919

EIF4A3, Eukaryotic initiation factor 4A-III, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EIF4A3P38919 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
EIF4A3P38919 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
EIF4A3P38919 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
EIF4A3P38919 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
EIF4A3P38919 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
EIF4A3P38919 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
EIF4A3P38919 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
EIF4A3P38919 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
EIF4A3P38919 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
EIF4A3P38919 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
EIF4A3P38919 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
EIF4A3P38919 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC24■■□□□ 1.43
EIF4A3P38919 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
EIF4A3P38919 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
EIF4A3P38919 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
EIF4A3P38919 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
EIF4A3P38919 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
EIF4A3P38919 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
EIF4A3P38919 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
EIF4A3P38919 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
EIF4A3P38919 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
EIF4A3P38919 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
EIF4A3P38919 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
EIF4A3P38919 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
EIF4A3P38919 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
EIF4A3P38919 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
EIF4A3P38919 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
EIF4A3P38919 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
EIF4A3P38919 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
EIF4A3P38919 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
EIF4A3P38919 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
EIF4A3P38919 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
EIF4A3P38919 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
EIF4A3P38919 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
EIF4A3P38919 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
EIF4A3P38919 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
EIF4A3P38919 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
EIF4A3P38919 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
EIF4A3P38919 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
EIF4A3P38919 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
EIF4A3P38919 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
EIF4A3P38919 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
EIF4A3P38919 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
EIF4A3P38919 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
EIF4A3P38919 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
EIF4A3P38919 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
EIF4A3P38919 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
EIF4A3P38919 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
EIF4A3P38919 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
EIF4A3P38919 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
EIF4A3P38919 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
EIF4A3P38919 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
EIF4A3P38919 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
EIF4A3P38919 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
EIF4A3P38919 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
EIF4A3P38919 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
EIF4A3P38919 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
EIF4A3P38919 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
EIF4A3P38919 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
EIF4A3P38919 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
EIF4A3P38919 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
EIF4A3P38919 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
EIF4A3P38919 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
EIF4A3P38919 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
EIF4A3P38919 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
EIF4A3P38919 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
EIF4A3P38919 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
EIF4A3P38919 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
EIF4A3P38919 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
EIF4A3P38919 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
EIF4A3P38919 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
EIF4A3P38919 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
EIF4A3P38919 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
EIF4A3P38919 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
EIF4A3P38919 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
EIF4A3P38919 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
EIF4A3P38919 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
EIF4A3P38919 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
EIF4A3P38919 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
EIF4A3P38919 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
EIF4A3P38919 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
EIF4A3P38919 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
EIF4A3P38919 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
EIF4A3P38919 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
EIF4A3P38919 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
EIF4A3P38919 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
EIF4A3P38919 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
EIF4A3P38919 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
EIF4A3P38919 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
EIF4A3P38919 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
EIF4A3P38919 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
EIF4A3P38919 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
EIF4A3P38919 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
EIF4A3P38919 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
EIF4A3P38919 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
EIF4A3P38919 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
EIF4A3P38919 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
EIF4A3P38919 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
EIF4A3P38919 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
EIF4A3P38919 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.9 ms