Protein–RNA interactions for Protein: P35846

Folr1, Folate receptor alpha, mousemouse

Predictions only

Length 255 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Folr1P35846 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Folr1P35846 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Folr1P35846 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Folr1P35846 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Folr1P35846 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Folr1P35846 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Folr1P35846 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Folr1P35846 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Folr1P35846 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Folr1P35846 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Folr1P35846 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Folr1P35846 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Folr1P35846 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Folr1P35846 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Folr1P35846 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Folr1P35846 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Folr1P35846 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Folr1P35846 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Folr1P35846 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Folr1P35846 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Folr1P35846 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Folr1P35846 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Folr1P35846 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Folr1P35846 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Folr1P35846 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Folr1P35846 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Folr1P35846 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Folr1P35846 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Folr1P35846 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Folr1P35846 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Folr1P35846 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Folr1P35846 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Folr1P35846 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Folr1P35846 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Folr1P35846 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Folr1P35846 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Folr1P35846 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Folr1P35846 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Folr1P35846 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Folr1P35846 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Folr1P35846 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Folr1P35846 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Folr1P35846 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Folr1P35846 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Folr1P35846 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Folr1P35846 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Folr1P35846 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Folr1P35846 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Folr1P35846 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Folr1P35846 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Folr1P35846 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Folr1P35846 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Folr1P35846 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Folr1P35846 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Folr1P35846 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Folr1P35846 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Folr1P35846 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Folr1P35846 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Folr1P35846 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Folr1P35846 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Folr1P35846 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Folr1P35846 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Folr1P35846 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Folr1P35846 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Folr1P35846 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Folr1P35846 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Folr1P35846 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Folr1P35846 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Folr1P35846 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Folr1P35846 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Folr1P35846 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Folr1P35846 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Folr1P35846 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Folr1P35846 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Folr1P35846 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Folr1P35846 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Folr1P35846 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Folr1P35846 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Folr1P35846 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Folr1P35846 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Folr1P35846 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Folr1P35846 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Folr1P35846 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Folr1P35846 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Folr1P35846 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Folr1P35846 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Folr1P35846 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Folr1P35846 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Folr1P35846 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Folr1P35846 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Folr1P35846 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Folr1P35846 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Folr1P35846 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Folr1P35846 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Folr1P35846 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Folr1P35846 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Folr1P35846 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Folr1P35846 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Folr1P35846 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Folr1P35846 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.1 ms