Protein–RNA interactions for Protein: P35459

Ly6d, Lymphocyte antigen 6D, mousemouse

Predictions only

Length 127 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ly6dP35459 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ly6dP35459 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ly6dP35459 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ly6dP35459 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Ly6dP35459 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ly6dP35459 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ly6dP35459 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ly6dP35459 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ly6dP35459 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Ly6dP35459 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ly6dP35459 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ly6dP35459 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Ly6dP35459 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ly6dP35459 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Ly6dP35459 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Ly6dP35459 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ly6dP35459 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Ly6dP35459 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ly6dP35459 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ly6dP35459 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ly6dP35459 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ly6dP35459 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ly6dP35459 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ly6dP35459 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ly6dP35459 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Ly6dP35459 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ly6dP35459 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ly6dP35459 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ly6dP35459 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ly6dP35459 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ly6dP35459 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ly6dP35459 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ly6dP35459 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ly6dP35459 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ly6dP35459 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ly6dP35459 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Ly6dP35459 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ly6dP35459 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ly6dP35459 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ly6dP35459 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ly6dP35459 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Ly6dP35459 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ly6dP35459 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ly6dP35459 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Ly6dP35459 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Ly6dP35459 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ly6dP35459 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ly6dP35459 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ly6dP35459 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ly6dP35459 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ly6dP35459 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ly6dP35459 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ly6dP35459 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Ly6dP35459 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ly6dP35459 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ly6dP35459 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ly6dP35459 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ly6dP35459 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ly6dP35459 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ly6dP35459 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ly6dP35459 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ly6dP35459 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ly6dP35459 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ly6dP35459 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ly6dP35459 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ly6dP35459 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ly6dP35459 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ly6dP35459 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ly6dP35459 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ly6dP35459 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ly6dP35459 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ly6dP35459 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ly6dP35459 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ly6dP35459 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ly6dP35459 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ly6dP35459 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ly6dP35459 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ly6dP35459 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ly6dP35459 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ly6dP35459 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ly6dP35459 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Ly6dP35459 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ly6dP35459 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ly6dP35459 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ly6dP35459 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ly6dP35459 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ly6dP35459 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ly6dP35459 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ly6dP35459 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ly6dP35459 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ly6dP35459 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ly6dP35459 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ly6dP35459 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ly6dP35459 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ly6dP35459 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ly6dP35459 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ly6dP35459 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Ly6dP35459 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ly6dP35459 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ly6dP35459 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms