Protein–RNA interactions for Protein: P32958

Rom1, Rod outer segment membrane protein 1, mousemouse

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Length 351 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rom1P32958 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rom1P32958 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rom1P32958 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rom1P32958 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rom1P32958 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rom1P32958 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rom1P32958 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rom1P32958 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rom1P32958 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rom1P32958 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rom1P32958 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rom1P32958 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rom1P32958 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rom1P32958 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rom1P32958 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rom1P32958 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rom1P32958 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rom1P32958 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rom1P32958 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rom1P32958 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rom1P32958 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rom1P32958 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rom1P32958 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rom1P32958 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rom1P32958 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rom1P32958 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rom1P32958 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rom1P32958 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rom1P32958 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rom1P32958 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rom1P32958 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rom1P32958 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rom1P32958 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rom1P32958 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rom1P32958 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rom1P32958 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rom1P32958 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rom1P32958 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rom1P32958 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rom1P32958 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rom1P32958 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rom1P32958 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rom1P32958 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Rom1P32958 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rom1P32958 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rom1P32958 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rom1P32958 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rom1P32958 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rom1P32958 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rom1P32958 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rom1P32958 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rom1P32958 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rom1P32958 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Rom1P32958 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rom1P32958 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rom1P32958 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rom1P32958 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rom1P32958 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rom1P32958 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rom1P32958 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rom1P32958 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rom1P32958 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rom1P32958 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rom1P32958 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rom1P32958 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rom1P32958 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rom1P32958 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Rom1P32958 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Rom1P32958 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rom1P32958 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rom1P32958 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rom1P32958 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rom1P32958 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rom1P32958 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rom1P32958 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rom1P32958 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rom1P32958 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rom1P32958 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rom1P32958 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rom1P32958 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rom1P32958 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rom1P32958 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rom1P32958 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rom1P32958 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rom1P32958 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rom1P32958 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rom1P32958 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rom1P32958 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rom1P32958 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rom1P32958 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rom1P32958 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rom1P32958 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rom1P32958 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rom1P32958 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rom1P32958 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rom1P32958 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rom1P32958 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rom1P32958 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rom1P32958 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rom1P32958 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
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