Protein–RNA interactions for Protein: P30548

Tacr1, Substance-P receptor, mousemouse

Predictions only

Length 407 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tacr1P30548 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tacr1P30548 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tacr1P30548 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tacr1P30548 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tacr1P30548 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tacr1P30548 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tacr1P30548 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tacr1P30548 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Tacr1P30548 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tacr1P30548 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tacr1P30548 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tacr1P30548 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tacr1P30548 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tacr1P30548 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tacr1P30548 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tacr1P30548 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tacr1P30548 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tacr1P30548 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tacr1P30548 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tacr1P30548 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tacr1P30548 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tacr1P30548 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tacr1P30548 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tacr1P30548 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tacr1P30548 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tacr1P30548 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Tacr1P30548 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
Tacr1P30548 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tacr1P30548 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tacr1P30548 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tacr1P30548 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tacr1P30548 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tacr1P30548 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tacr1P30548 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tacr1P30548 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tacr1P30548 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tacr1P30548 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tacr1P30548 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tacr1P30548 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Tacr1P30548 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tacr1P30548 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Tacr1P30548 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tacr1P30548 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tacr1P30548 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tacr1P30548 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tacr1P30548 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tacr1P30548 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tacr1P30548 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tacr1P30548 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tacr1P30548 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tacr1P30548 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tacr1P30548 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tacr1P30548 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tacr1P30548 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tacr1P30548 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tacr1P30548 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tacr1P30548 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tacr1P30548 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tacr1P30548 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tacr1P30548 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tacr1P30548 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tacr1P30548 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tacr1P30548 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tacr1P30548 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tacr1P30548 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tacr1P30548 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tacr1P30548 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tacr1P30548 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tacr1P30548 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tacr1P30548 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tacr1P30548 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tacr1P30548 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tacr1P30548 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tacr1P30548 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tacr1P30548 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tacr1P30548 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tacr1P30548 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tacr1P30548 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tacr1P30548 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tacr1P30548 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tacr1P30548 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tacr1P30548 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tacr1P30548 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tacr1P30548 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tacr1P30548 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tacr1P30548 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tacr1P30548 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tacr1P30548 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tacr1P30548 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tacr1P30548 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tacr1P30548 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Tacr1P30548 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tacr1P30548 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tacr1P30548 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tacr1P30548 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tacr1P30548 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tacr1P30548 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tacr1P30548 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tacr1P30548 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Tacr1P30548 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.4 ms