Protein–RNA interactions for Protein: P30280

Ccnd2, G1/S-specific cyclin-D2, mousemouse

Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccnd2P30280 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ccnd2P30280 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ccnd2P30280 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ccnd2P30280 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ccnd2P30280 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ccnd2P30280 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ccnd2P30280 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ccnd2P30280 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ccnd2P30280 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ccnd2P30280 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ccnd2P30280 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ccnd2P30280 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ccnd2P30280 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ccnd2P30280 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ccnd2P30280 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ccnd2P30280 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ccnd2P30280 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ccnd2P30280 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ccnd2P30280 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ccnd2P30280 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ccnd2P30280 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ccnd2P30280 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ccnd2P30280 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ccnd2P30280 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ccnd2P30280 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ccnd2P30280 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ccnd2P30280 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ccnd2P30280 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ccnd2P30280 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ccnd2P30280 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Ccnd2P30280 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ccnd2P30280 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Ccnd2P30280 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ccnd2P30280 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ccnd2P30280 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ccnd2P30280 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ccnd2P30280 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ccnd2P30280 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ccnd2P30280 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ccnd2P30280 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ccnd2P30280 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ccnd2P30280 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ccnd2P30280 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ccnd2P30280 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ccnd2P30280 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ccnd2P30280 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ccnd2P30280 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ccnd2P30280 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Ccnd2P30280 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ccnd2P30280 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ccnd2P30280 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ccnd2P30280 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ccnd2P30280 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccnd2P30280 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccnd2P30280 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccnd2P30280 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccnd2P30280 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccnd2P30280 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccnd2P30280 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccnd2P30280 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccnd2P30280 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccnd2P30280 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccnd2P30280 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccnd2P30280 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccnd2P30280 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccnd2P30280 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccnd2P30280 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccnd2P30280 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccnd2P30280 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccnd2P30280 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccnd2P30280 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccnd2P30280 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccnd2P30280 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccnd2P30280 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccnd2P30280 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccnd2P30280 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccnd2P30280 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccnd2P30280 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccnd2P30280 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccnd2P30280 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccnd2P30280 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccnd2P30280 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccnd2P30280 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccnd2P30280 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccnd2P30280 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccnd2P30280 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccnd2P30280 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccnd2P30280 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccnd2P30280 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccnd2P30280 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccnd2P30280 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccnd2P30280 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Ccnd2P30280 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ccnd2P30280 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ccnd2P30280 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ccnd2P30280 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ccnd2P30280 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ccnd2P30280 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ccnd2P30280 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ccnd2P30280 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms