Protein–RNA interactions for Protein: P28741

Kif3a, Kinesin-like protein KIF3A, mousemouse

Predictions only

Length 701 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kif3aP28741 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Kif3aP28741 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Kif3aP28741 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Kif3aP28741 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Kif3aP28741 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Kif3aP28741 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Kif3aP28741 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Kif3aP28741 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Kif3aP28741 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Kif3aP28741 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Kif3aP28741 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Kif3aP28741 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Kif3aP28741 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Kif3aP28741 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Kif3aP28741 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Kif3aP28741 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Kif3aP28741 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Kif3aP28741 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Kif3aP28741 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Kif3aP28741 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Kif3aP28741 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Kif3aP28741 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Kif3aP28741 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Kif3aP28741 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Kif3aP28741 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Kif3aP28741 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Kif3aP28741 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Kif3aP28741 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Kif3aP28741 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Kif3aP28741 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Kif3aP28741 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Kif3aP28741 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Kif3aP28741 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Kif3aP28741 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Kif3aP28741 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Kif3aP28741 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Kif3aP28741 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Kif3aP28741 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Kif3aP28741 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Kif3aP28741 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Kif3aP28741 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Kif3aP28741 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Kif3aP28741 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Kif3aP28741 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Kif3aP28741 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Kif3aP28741 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Kif3aP28741 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Kif3aP28741 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Kif3aP28741 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Kif3aP28741 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Kif3aP28741 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Kif3aP28741 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Kif3aP28741 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Kif3aP28741 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Kif3aP28741 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Kif3aP28741 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Kif3aP28741 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Kif3aP28741 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Kif3aP28741 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Kif3aP28741 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Kif3aP28741 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Kif3aP28741 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Kif3aP28741 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Kif3aP28741 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Kif3aP28741 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Kif3aP28741 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Kif3aP28741 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Kif3aP28741 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Kif3aP28741 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Kif3aP28741 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Kif3aP28741 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Kif3aP28741 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Kif3aP28741 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Kif3aP28741 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Kif3aP28741 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Kif3aP28741 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Kif3aP28741 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Kif3aP28741 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Kif3aP28741 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Kif3aP28741 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Kif3aP28741 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Kif3aP28741 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Kif3aP28741 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Kif3aP28741 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Kif3aP28741 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Kif3aP28741 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Kif3aP28741 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Kif3aP28741 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Kif3aP28741 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Kif3aP28741 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Kif3aP28741 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Kif3aP28741 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Kif3aP28741 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Kif3aP28741 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Kif3aP28741 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Kif3aP28741 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Kif3aP28741 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Kif3aP28741 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Kif3aP28741 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Kif3aP28741 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.2 ms