Protein–RNA interactions for Protein: P28004

PRP45, Pre-mRNA-processing protein 45, yeastyeast

Predicted RBP Predictions only

Length 379 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
PRP45P28004 YDL183CYDL183C 963 nt5.31□□□□□ -1.56
PRP45P28004 CDC42YLR229C 576 nt5.31□□□□□ -1.56
PRP45P28004 YLR311CYLR311C 348 nt5.31□□□□□ -1.56
PRP45P28004 HEK2YBL032W 1146 nt5.31□□□□□ -1.56
PRP45P28004 snR17bsnR17b 332 nt5.31□□□□□ -1.56
PRP45P28004 NSI1YDR026C 1713 nt5.31□□□□□ -1.56
PRP45P28004 IPI3YNL182C 1668 nt5.31□□□□□ -1.56
PRP45P28004 BRE4YDL231C 3378 nt5.3□□□□□ -1.56
PRP45P28004 SMP1YBR182C 1359 nt5.3□□□□□ -1.56
PRP45P28004 BSC1YDL037C 987 nt5.3□□□□□ -1.56
PRP45P28004 NSE3YDR288W 912 nt5.3□□□□□ -1.56
PRP45P28004 AUA1YFL010W-A 285 nt5.3□□□□□ -1.56
PRP45P28004 YHR137C-AYHR137C-A 651 nt5.3□□□□□ -1.56
PRP45P28004 MRPL6YHR147C 645 nt5.3□□□□□ -1.56
PRP45P28004 HMX1YLR205C 954 nt5.3□□□□□ -1.56
PRP45P28004 ECM33YBR078W 1290 nt5.3□□□□□ -1.56
PRP45P28004 TGL1YKL140W 1647 nt5.3□□□□□ -1.56
PRP45P28004 EUG1YDR518W 1554 nt5.29□□□□□ -1.56
PRP45P28004 SET5YHR207C 1581 nt5.29□□□□□ -1.56
PRP45P28004 SUB2YDL084W 1341 nt5.29□□□□□ -1.56
PRP45P28004 YHL012WYHL012W 1482 nt5.29□□□□□ -1.56
PRP45P28004 IRC6YFR043C 714 nt5.29□□□□□ -1.56
PRP45P28004 SKI6YGR195W 741 nt5.29□□□□□ -1.56
PRP45P28004 RDN5-1RDN5-1 121 nt5.29□□□□□ -1.56
PRP45P28004 RDN5-6RDN5-6 121 nt5.29□□□□□ -1.56
PRP45P28004 YLR326WYLR326W 723 nt5.29□□□□□ -1.56
PRP45P28004 YPR015CYPR015C 744 nt5.29□□□□□ -1.56
PRP45P28004 PCS60YBR222C 1632 nt5.29□□□□□ -1.56
PRP45P28004 YJL206CYJL206C 2277 nt5.28□□□□□ -1.56
PRP45P28004 CLA4YNL298W 2529 nt5.28□□□□□ -1.56
PRP45P28004 VAN1YML115C 1608 nt5.28□□□□□ -1.56
PRP45P28004 YKL162C-AYKL162C-A 153 nt5.28□□□□□ -1.56
PRP45P28004 YLR374CYLR374C 390 nt5.28□□□□□ -1.56
PRP45P28004 YMR030W-AYMR030W-A 291 nt5.28□□□□□ -1.56
PRP45P28004 BAG7YOR134W 1230 nt5.28□□□□□ -1.56
PRP45P28004 SSP2YOR242C 1116 nt5.28□□□□□ -1.56
PRP45P28004 NRG2YBR066C 663 nt5.28□□□□□ -1.56
PRP45P28004 YER158CYER158C 1722 nt5.28□□□□□ -1.56
PRP45P28004 CBP1YJL209W 1965 nt5.27□□□□□ -1.57
PRP45P28004 RSM10YDR041W 612 nt5.27□□□□□ -1.57
PRP45P28004 tC(GCA)BtC(GCA)B 72 nt5.27□□□□□ -1.57
PRP45P28004 tC(GCA)GtC(GCA)G 72 nt5.27□□□□□ -1.57
PRP45P28004 tC(GCA)P1tC(GCA)P1 72 nt5.27□□□□□ -1.57
PRP45P28004 tC(GCA)P2tC(GCA)P2 72 nt5.27□□□□□ -1.57
PRP45P28004 RIP1YEL024W 648 nt5.27□□□□□ -1.57
PRP45P28004 YIL171WYIL171W 330 nt5.27□□□□□ -1.57
PRP45P28004 PAU17YLL025W 375 nt5.27□□□□□ -1.57
PRP45P28004 UBC12YLR306W 567 nt5.27□□□□□ -1.57
PRP45P28004 RAD52YML032C 1416 nt5.27□□□□□ -1.57
PRP45P28004 FOB1YDR110W 1701 nt5.26□□□□□ -1.57
PRP45P28004 SDS3YIL084C 984 nt5.26□□□□□ -1.57
PRP45P28004 YLR225CYLR225C 1224 nt5.26□□□□□ -1.57
PRP45P28004 snR3snR3 194 nt5.26□□□□□ -1.57
PRP45P28004 SLX1YBR228W 915 nt5.26□□□□□ -1.57
PRP45P28004 PRR2YDL214C 2100 nt5.26□□□□□ -1.57
PRP45P28004 FAR10YLR238W 1437 nt5.25□□□□□ -1.57
PRP45P28004 PMA1YGL008C 2757 nt5.25□□□□□ -1.57
PRP45P28004 DOS2YDR068W 933 nt5.25□□□□□ -1.57
PRP45P28004 YDR396WYDR396W 501 nt5.25□□□□□ -1.57
PRP45P28004 NAT2YGR147C 867 nt5.25□□□□□ -1.57
PRP45P28004 OKP1YGR179C 1221 nt5.25□□□□□ -1.57
PRP45P28004 MRP4YHL004W 1185 nt5.25□□□□□ -1.57
PRP45P28004 HIS6YIL020C 786 nt5.25□□□□□ -1.57
PRP45P28004 ILV5YLR355C 1188 nt5.25□□□□□ -1.57
PRP45P28004 FBP1YLR377C 1047 nt5.25□□□□□ -1.57
PRP45P28004 MRPS8YMR158W 468 nt5.25□□□□□ -1.57
PRP45P28004 CTL1YMR180C 963 nt5.25□□□□□ -1.57
PRP45P28004 ASI2YNL159C 870 nt5.25□□□□□ -1.57
PRP45P28004 YOL038C-AYOL038C-A 96 nt5.25□□□□□ -1.57
PRP45P28004 CEX1YOR112W 2286 nt5.25□□□□□ -1.57
PRP45P28004 GCR2YNL199C 1605 nt5.24□□□□□ -1.57
PRP45P28004 YGL214WYGL214W 486 nt5.24□□□□□ -1.57
PRP45P28004 tQ(UUG)CtQ(UUG)C 72 nt5.24□□□□□ -1.57
PRP45P28004 tQ(UUG)D1tQ(UUG)D1 72 nt5.24□□□□□ -1.57
PRP45P28004 tQ(UUG)D2tQ(UUG)D2 72 nt5.24□□□□□ -1.57
PRP45P28004 tQ(UUG)D3tQ(UUG)D3 72 nt5.24□□□□□ -1.57
PRP45P28004 tQ(UUG)E1tQ(UUG)E1 72 nt5.24□□□□□ -1.57
PRP45P28004 tQ(UUG)HtQ(UUG)H 72 nt5.24□□□□□ -1.57
PRP45P28004 tQ(UUG)LtQ(UUG)L 72 nt5.24□□□□□ -1.57
PRP45P28004 YIL152WYIL152W 708 nt5.24□□□□□ -1.57
PRP45P28004 LTO1YNL260C 597 nt5.24□□□□□ -1.57
PRP45P28004 CWC27YPL064C 906 nt5.24□□□□□ -1.57
PRP45P28004 RAD16YBR114W 2373 nt5.23□□□□□ -1.57
PRP45P28004 LAS1YKR063C 1509 nt5.23□□□□□ -1.57
PRP45P28004 STE13YOR219C 2796 nt5.23□□□□□ -1.57
PRP45P28004 ARO80YDR421W 2853 nt5.23□□□□□ -1.57
PRP45P28004 IFM1YOL023W 2031 nt5.23□□□□□ -1.57
PRP45P28004 YDR090CYDR090C 933 nt5.23□□□□□ -1.57
PRP45P28004 YIL089WYIL089W 618 nt5.23□□□□□ -1.57
PRP45P28004 SPO20YMR017W 1194 nt5.23□□□□□ -1.57
PRP45P28004 IMP1YMR150C 573 nt5.23□□□□□ -1.57
PRP45P28004 GAS2YLR343W 1668 nt5.23□□□□□ -1.57
PRP45P28004 YIR007WYIR007W 2295 nt5.23□□□□□ -1.57
PRP45P28004 MET3YJR010W 1536 nt5.23□□□□□ -1.57
PRP45P28004 YNR065CYNR065C 3351 nt5.22□□□□□ -1.57
PRP45P28004 KRE6YPR159W 2163 nt5.22□□□□□ -1.57
PRP45P28004 MNT2YGL257C 1677 nt5.22□□□□□ -1.57
PRP45P28004 RAD7YJR052W 1698 nt5.22□□□□□ -1.57
PRP45P28004 snR7-SsnR7-S 179 nt5.22□□□□□ -1.57
PRP45P28004 YDR230WYDR230W 348 nt5.22□□□□□ -1.57
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