Protein–RNA interactions for Protein: P27801

PEP3, Vacuolar membrane protein PEP3, yeastyeast

Predictions only

Length 918 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
PEP3P27801 CDC42YLR229C 576 nt4.93□□□□□ -1.62
PEP3P27801 YLR326WYLR326W 723 nt4.93□□□□□ -1.62
PEP3P27801 CUS2YNL286W 858 nt4.93□□□□□ -1.62
PEP3P27801 SNF3YDL194W 2655 nt4.93□□□□□ -1.62
PEP3P27801 MOT2YER068W 1764 nt4.93□□□□□ -1.62
PEP3P27801 ARN1YHL040C 1884 nt4.92□□□□□ -1.62
PEP3P27801 KRS1YDR037W 1776 nt4.92□□□□□ -1.62
PEP3P27801 RXT3YDL076C 885 nt4.92□□□□□ -1.62
PEP3P27801 YDR056CYDR056C 618 nt4.92□□□□□ -1.62
PEP3P27801 CNL1YDR357C 369 nt4.92□□□□□ -1.62
PEP3P27801 CNB1YKL190W 528 nt4.92□□□□□ -1.62
PEP3P27801 YMR082CYMR082C 357 nt4.92□□□□□ -1.62
PEP3P27801 BSD2YBR290W 966 nt4.92□□□□□ -1.62
PEP3P27801 GGA1YDR358W 1674 nt4.92□□□□□ -1.62
PEP3P27801 CYM1YDR430C 2970 nt4.92□□□□□ -1.62
PEP3P27801 SPR28YDR218C 1272 nt4.91□□□□□ -1.62
PEP3P27801 NPY1YGL067W 1155 nt4.91□□□□□ -1.62
PEP3P27801 YBL077WYBL077W 432 nt4.91□□□□□ -1.62
PEP3P27801 YOR008W-BYOR008W-B 102 nt4.91□□□□□ -1.62
PEP3P27801 VPS28YPL065W 729 nt4.91□□□□□ -1.62
PEP3P27801 VHS2YIL135C 1311 nt4.91□□□□□ -1.62
PEP3P27801 KAP114YGL241W 3015 nt4.91□□□□□ -1.62
PEP3P27801 KRE28YDR532C 1158 nt4.9□□□□□ -1.63
PEP3P27801 tQ(UUG)CtQ(UUG)C 72 nt4.9□□□□□ -1.63
PEP3P27801 tQ(UUG)D1tQ(UUG)D1 72 nt4.9□□□□□ -1.63
PEP3P27801 tQ(UUG)D2tQ(UUG)D2 72 nt4.9□□□□□ -1.63
PEP3P27801 tQ(UUG)D3tQ(UUG)D3 72 nt4.9□□□□□ -1.63
PEP3P27801 tQ(UUG)E1tQ(UUG)E1 72 nt4.9□□□□□ -1.63
PEP3P27801 tQ(UUG)HtQ(UUG)H 72 nt4.9□□□□□ -1.63
PEP3P27801 tQ(UUG)LtQ(UUG)L 72 nt4.9□□□□□ -1.63
PEP3P27801 SNL1YIL016W 480 nt4.9□□□□□ -1.63
PEP3P27801 YLR374CYLR374C 390 nt4.9□□□□□ -1.63
PEP3P27801 THS1YIL078W 2205 nt4.9□□□□□ -1.63
PEP3P27801 RNY1YPL123C 1305 nt4.9□□□□□ -1.63
PEP3P27801 PEP5YMR231W 3090 nt4.89□□□□□ -1.63
PEP3P27801 YHL012WYHL012W 1482 nt4.89□□□□□ -1.63
PEP3P27801 ASK10YGR097W 3441 nt4.89□□□□□ -1.63
PEP3P27801 STB3YDR169C 1542 nt4.89□□□□□ -1.63
PEP3P27801 YCR023CYCR023C 1836 nt4.89□□□□□ -1.63
PEP3P27801 GCV1YDR019C 1203 nt4.89□□□□□ -1.63
PEP3P27801 COS4YFL062W 1140 nt4.89□□□□□ -1.63
PEP3P27801 BNA6YFR047C 888 nt4.89□□□□□ -1.63
PEP3P27801 YGR015CYGR015C 987 nt4.89□□□□□ -1.63
PEP3P27801 RAD27YKL113C 1149 nt4.89□□□□□ -1.63
PEP3P27801 YAR030CYAR030C 342 nt4.89□□□□□ -1.63
PEP3P27801 YLR157W-DYLR157W-D 213 nt4.89□□□□□ -1.63
PEP3P27801 YLR225CYLR225C 1224 nt4.89□□□□□ -1.63
PEP3P27801 COS3YML132W 1140 nt4.89□□□□□ -1.63
PEP3P27801 COS2YBR302C 1140 nt4.89□□□□□ -1.63
PEP3P27801 ESF1YDR365C 1887 nt4.89□□□□□ -1.63
PEP3P27801 TOS3YGL179C 1683 nt4.89□□□□□ -1.63
PEP3P27801 SEC39YLR440C 2130 nt4.88□□□□□ -1.63
PEP3P27801 PEX19YDL065C 1029 nt4.88□□□□□ -1.63
PEP3P27801 API2YDR525W 330 nt4.88□□□□□ -1.63
PEP3P27801 YGR079WYGR079W 1113 nt4.88□□□□□ -1.63
PEP3P27801 YIM2YMR151W 438 nt4.88□□□□□ -1.63
PEP3P27801 TPP1YMR156C 717 nt4.88□□□□□ -1.63
PEP3P27801 YBR134WYBR134W 402 nt4.88□□□□□ -1.63
PEP3P27801 TRM11YOL124C 1302 nt4.88□□□□□ -1.63
PEP3P27801 LAP3YNL239W 1365 nt4.88□□□□□ -1.63
PEP3P27801 RFT1YBL020W 1725 nt4.87□□□□□ -1.63
PEP3P27801 YHP1YDR451C 1062 nt4.87□□□□□ -1.63
PEP3P27801 YER133W-AYER133W-A 342 nt4.87□□□□□ -1.63
PEP3P27801 MNN11YJL183W 1269 nt4.87□□□□□ -1.63
PEP3P27801 CPR6YLR216C 1116 nt4.87□□□□□ -1.63
PEP3P27801 YML031C-AYML031C-A 336 nt4.87□□□□□ -1.63
PEP3P27801 YPL114WYPL114W 420 nt4.87□□□□□ -1.63
PEP3P27801 PRP43YGL120C 2304 nt4.87□□□□□ -1.63
PEP3P27801 OCT1YKL134C 2319 nt4.87□□□□□ -1.63
PEP3P27801 PXA1YPL147W 2613 nt4.87□□□□□ -1.63
PEP3P27801 RGP1YDR137W 1992 nt4.86□□□□□ -1.63
PEP3P27801 TAF10YDR167W 621 nt4.86□□□□□ -1.63
PEP3P27801 YIL171WYIL171W 330 nt4.86□□□□□ -1.63
PEP3P27801 EFB1YAL003W 621 nt4.86□□□□□ -1.63
PEP3P27801 REX3YLR107W 1215 nt4.86□□□□□ -1.63
PEP3P27801 VPS68YOL129W 555 nt4.86□□□□□ -1.63
PEP3P27801 YBR219CYBR219C 384 nt4.86□□□□□ -1.63
PEP3P27801 RKM2YDR198C 1440 nt4.86□□□□□ -1.63
PEP3P27801 FRT2YAL028W 1587 nt4.86□□□□□ -1.63
PEP3P27801 TGL1YKL140W 1647 nt4.86□□□□□ -1.63
PEP3P27801 HPC2YBR215W 1878 nt4.86□□□□□ -1.63
PEP3P27801 RPG1YBR079C 2895 nt4.85□□□□□ -1.63
PEP3P27801 RPC53YDL150W 1269 nt4.85□□□□□ -1.63
PEP3P27801 COS7YDL248W 1152 nt4.85□□□□□ -1.63
PEP3P27801 PHO92YDR374C 921 nt4.85□□□□□ -1.63
PEP3P27801 DUO1YGL061C 744 nt4.85□□□□□ -1.63
PEP3P27801 COS5YJR161C 1152 nt4.85□□□□□ -1.63
PEP3P27801 RDN5-1RDN5-1 121 nt4.85□□□□□ -1.63
PEP3P27801 RDN5-6RDN5-6 121 nt4.85□□□□□ -1.63
PEP3P27801 YBL010CYBL010C 843 nt4.85□□□□□ -1.63
PEP3P27801 CDC21YOR074C 915 nt4.85□□□□□ -1.63
PEP3P27801 YBR126W-AYBR126W-A 207 nt4.85□□□□□ -1.63
PEP3P27801 LAS1YKR063C 1509 nt4.85□□□□□ -1.63
PEP3P27801 APC1YNL172W 5247 nt4.85□□□□□ -1.63
PEP3P27801 ADY3YDL239C 2373 nt4.85□□□□□ -1.63
PEP3P27801 PSE1YMR308C 3270 nt4.85□□□□□ -1.63
PEP3P27801 MBP1YDL056W 2502 nt4.84□□□□□ -1.63
PEP3P27801 HOYDL227C 1761 nt4.84□□□□□ -1.63
PEP3P27801 PEX30YLR324W 1572 nt4.84□□□□□ -1.63
PEP3P27801 PHO12YHR215W 1404 nt4.84□□□□□ -1.63
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 84.1 ms