Protein–RNA interactions for Protein: P20827

EFNA1, Ephrin-A1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNA1P20827 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
EFNA1P20827 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
EFNA1P20827 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
EFNA1P20827 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
EFNA1P20827 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
EFNA1P20827 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
EFNA1P20827 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
EFNA1P20827 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
EFNA1P20827 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
EFNA1P20827 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
EFNA1P20827 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
EFNA1P20827 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
EFNA1P20827 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
EFNA1P20827 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
EFNA1P20827 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
EFNA1P20827 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
EFNA1P20827 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
EFNA1P20827 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
EFNA1P20827 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
EFNA1P20827 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
EFNA1P20827 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
EFNA1P20827 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
EFNA1P20827 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
EFNA1P20827 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
EFNA1P20827 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
EFNA1P20827 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
EFNA1P20827 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
EFNA1P20827 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
EFNA1P20827 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
EFNA1P20827 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
EFNA1P20827 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
EFNA1P20827 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
EFNA1P20827 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
EFNA1P20827 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
EFNA1P20827 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
EFNA1P20827 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
EFNA1P20827 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
EFNA1P20827 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
EFNA1P20827 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
EFNA1P20827 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
EFNA1P20827 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
EFNA1P20827 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
EFNA1P20827 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
EFNA1P20827 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
EFNA1P20827 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
EFNA1P20827 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
EFNA1P20827 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
EFNA1P20827 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
EFNA1P20827 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
EFNA1P20827 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
EFNA1P20827 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
EFNA1P20827 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
EFNA1P20827 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
EFNA1P20827 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
EFNA1P20827 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
EFNA1P20827 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
EFNA1P20827 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
EFNA1P20827 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
EFNA1P20827 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
EFNA1P20827 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
EFNA1P20827 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
EFNA1P20827 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
EFNA1P20827 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
EFNA1P20827 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
EFNA1P20827 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
EFNA1P20827 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
EFNA1P20827 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
EFNA1P20827 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
EFNA1P20827 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
EFNA1P20827 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
EFNA1P20827 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
EFNA1P20827 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
EFNA1P20827 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
EFNA1P20827 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
EFNA1P20827 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
EFNA1P20827 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
EFNA1P20827 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
EFNA1P20827 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
EFNA1P20827 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
EFNA1P20827 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
EFNA1P20827 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
EFNA1P20827 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
EFNA1P20827 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
EFNA1P20827 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
EFNA1P20827 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
EFNA1P20827 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
EFNA1P20827 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
EFNA1P20827 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
EFNA1P20827 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
EFNA1P20827 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
EFNA1P20827 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
EFNA1P20827 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
EFNA1P20827 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
EFNA1P20827 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
EFNA1P20827 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
EFNA1P20827 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
EFNA1P20827 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
EFNA1P20827 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
EFNA1P20827 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
EFNA1P20827 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.8 ms