Protein–RNA interactions for Protein: P16390

Kcna3, Potassium voltage-gated channel subfamily A member 3, mousemouse

Predictions only

Length 528 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcna3P16390 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Kcna3P16390 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Kcna3P16390 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Kcna3P16390 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Kcna3P16390 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Kcna3P16390 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Kcna3P16390 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Kcna3P16390 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Kcna3P16390 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Kcna3P16390 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Kcna3P16390 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Kcna3P16390 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Kcna3P16390 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Kcna3P16390 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Kcna3P16390 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Kcna3P16390 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Kcna3P16390 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Kcna3P16390 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Kcna3P16390 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Kcna3P16390 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Kcna3P16390 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Kcna3P16390 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Kcna3P16390 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Kcna3P16390 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Kcna3P16390 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Kcna3P16390 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Kcna3P16390 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Kcna3P16390 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Kcna3P16390 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Kcna3P16390 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Kcna3P16390 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Kcna3P16390 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Kcna3P16390 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Kcna3P16390 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Kcna3P16390 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Kcna3P16390 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Kcna3P16390 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Kcna3P16390 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Kcna3P16390 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Kcna3P16390 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Kcna3P16390 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Kcna3P16390 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Kcna3P16390 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Kcna3P16390 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Kcna3P16390 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Kcna3P16390 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Kcna3P16390 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Kcna3P16390 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Kcna3P16390 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Kcna3P16390 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Kcna3P16390 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Kcna3P16390 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Kcna3P16390 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Kcna3P16390 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Kcna3P16390 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Kcna3P16390 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Kcna3P16390 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Kcna3P16390 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Kcna3P16390 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Kcna3P16390 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Kcna3P16390 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Kcna3P16390 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Kcna3P16390 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Kcna3P16390 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Kcna3P16390 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Kcna3P16390 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Kcna3P16390 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Kcna3P16390 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Kcna3P16390 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Kcna3P16390 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Kcna3P16390 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Kcna3P16390 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Kcna3P16390 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Kcna3P16390 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Kcna3P16390 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Kcna3P16390 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Kcna3P16390 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Kcna3P16390 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Kcna3P16390 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Kcna3P16390 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Kcna3P16390 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Kcna3P16390 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Kcna3P16390 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Kcna3P16390 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Kcna3P16390 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Kcna3P16390 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Kcna3P16390 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Kcna3P16390 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Kcna3P16390 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Kcna3P16390 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Kcna3P16390 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Kcna3P16390 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Kcna3P16390 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Kcna3P16390 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Kcna3P16390 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Kcna3P16390 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Kcna3P16390 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Kcna3P16390 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Kcna3P16390 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Kcna3P16390 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.3 ms