Protein–RNA interactions for Protein: P13379

Cd5, T-cell surface glycoprotein CD5, mousemouse

Predictions only

Length 494 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd5P13379 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cd5P13379 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cd5P13379 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cd5P13379 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cd5P13379 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cd5P13379 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cd5P13379 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cd5P13379 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cd5P13379 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cd5P13379 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cd5P13379 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cd5P13379 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cd5P13379 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cd5P13379 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cd5P13379 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cd5P13379 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Cd5P13379 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cd5P13379 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cd5P13379 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cd5P13379 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cd5P13379 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cd5P13379 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cd5P13379 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cd5P13379 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cd5P13379 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Cd5P13379 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cd5P13379 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cd5P13379 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cd5P13379 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cd5P13379 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cd5P13379 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cd5P13379 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cd5P13379 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cd5P13379 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cd5P13379 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cd5P13379 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cd5P13379 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cd5P13379 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Cd5P13379 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Cd5P13379 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cd5P13379 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cd5P13379 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cd5P13379 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cd5P13379 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cd5P13379 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cd5P13379 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cd5P13379 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cd5P13379 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cd5P13379 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Cd5P13379 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cd5P13379 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cd5P13379 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cd5P13379 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Cd5P13379 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cd5P13379 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cd5P13379 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cd5P13379 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cd5P13379 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cd5P13379 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cd5P13379 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cd5P13379 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cd5P13379 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cd5P13379 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cd5P13379 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cd5P13379 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cd5P13379 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Cd5P13379 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cd5P13379 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cd5P13379 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cd5P13379 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cd5P13379 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cd5P13379 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cd5P13379 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cd5P13379 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cd5P13379 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cd5P13379 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cd5P13379 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Cd5P13379 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Cd5P13379 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cd5P13379 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cd5P13379 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cd5P13379 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cd5P13379 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cd5P13379 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cd5P13379 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cd5P13379 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cd5P13379 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cd5P13379 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cd5P13379 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cd5P13379 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cd5P13379 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cd5P13379 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cd5P13379 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cd5P13379 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cd5P13379 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Cd5P13379 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cd5P13379 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cd5P13379 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cd5P13379 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cd5P13379 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.3 ms