Protein–RNA interactions for Protein: O54818

Tpd52l1, Tumor protein D53, mousemouse

Predictions only

Length 204 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpd52l1O54818 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Tpd52l1O54818 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Tpd52l1O54818 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Tpd52l1O54818 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Tpd52l1O54818 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Tpd52l1O54818 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Tpd52l1O54818 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Tpd52l1O54818 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Tpd52l1O54818 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Tpd52l1O54818 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tpd52l1O54818 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tpd52l1O54818 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tpd52l1O54818 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tpd52l1O54818 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tpd52l1O54818 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tpd52l1O54818 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tpd52l1O54818 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tpd52l1O54818 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tpd52l1O54818 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tpd52l1O54818 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tpd52l1O54818 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tpd52l1O54818 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Tpd52l1O54818 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tpd52l1O54818 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tpd52l1O54818 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tpd52l1O54818 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Tpd52l1O54818 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Tpd52l1O54818 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Tpd52l1O54818 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Tpd52l1O54818 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Tpd52l1O54818 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Tpd52l1O54818 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Tpd52l1O54818 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Tpd52l1O54818 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Tpd52l1O54818 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Tpd52l1O54818 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Tpd52l1O54818 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Tpd52l1O54818 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Tpd52l1O54818 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Tpd52l1O54818 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Tpd52l1O54818 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Tpd52l1O54818 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Tpd52l1O54818 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Tpd52l1O54818 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Tpd52l1O54818 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Tpd52l1O54818 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Tpd52l1O54818 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Tpd52l1O54818 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Tpd52l1O54818 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Tpd52l1O54818 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Tpd52l1O54818 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Tpd52l1O54818 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Tpd52l1O54818 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Tpd52l1O54818 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Tpd52l1O54818 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Tpd52l1O54818 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Tpd52l1O54818 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Tpd52l1O54818 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Tpd52l1O54818 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Tpd52l1O54818 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Tpd52l1O54818 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Tpd52l1O54818 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Tpd52l1O54818 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Tpd52l1O54818 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Tpd52l1O54818 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Tpd52l1O54818 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Tpd52l1O54818 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Tpd52l1O54818 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Tpd52l1O54818 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Tpd52l1O54818 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Tpd52l1O54818 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Tpd52l1O54818 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Tpd52l1O54818 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Tpd52l1O54818 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Tpd52l1O54818 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Tpd52l1O54818 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Tpd52l1O54818 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Tpd52l1O54818 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Tpd52l1O54818 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Tpd52l1O54818 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Tpd52l1O54818 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Tpd52l1O54818 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Tpd52l1O54818 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Tpd52l1O54818 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Tpd52l1O54818 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Tpd52l1O54818 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Tpd52l1O54818 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Tpd52l1O54818 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Tpd52l1O54818 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Tpd52l1O54818 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Tpd52l1O54818 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Tpd52l1O54818 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Tpd52l1O54818 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Tpd52l1O54818 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Tpd52l1O54818 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Tpd52l1O54818 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Tpd52l1O54818 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Tpd52l1O54818 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Tpd52l1O54818 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Tpd52l1O54818 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 109.5 ms