Protein–RNA interactions for Protein: O35709

Enc1, Ectoderm-neural cortex protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 589 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Enc1O35709 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Enc1O35709 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Enc1O35709 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Enc1O35709 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Enc1O35709 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Enc1O35709 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Enc1O35709 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Enc1O35709 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Enc1O35709 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Enc1O35709 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Enc1O35709 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Enc1O35709 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Enc1O35709 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Enc1O35709 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Enc1O35709 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Enc1O35709 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Enc1O35709 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Enc1O35709 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Enc1O35709 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Enc1O35709 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Enc1O35709 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Enc1O35709 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Enc1O35709 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Enc1O35709 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Enc1O35709 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Enc1O35709 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Enc1O35709 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Enc1O35709 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Enc1O35709 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Enc1O35709 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Enc1O35709 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Enc1O35709 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Enc1O35709 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Enc1O35709 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Enc1O35709 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Enc1O35709 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Enc1O35709 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Enc1O35709 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Enc1O35709 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Enc1O35709 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Enc1O35709 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Enc1O35709 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Enc1O35709 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Enc1O35709 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Enc1O35709 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Enc1O35709 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Enc1O35709 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Enc1O35709 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Enc1O35709 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Enc1O35709 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Enc1O35709 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Enc1O35709 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Enc1O35709 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Enc1O35709 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Enc1O35709 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Enc1O35709 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Enc1O35709 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Enc1O35709 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Enc1O35709 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Enc1O35709 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Enc1O35709 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Enc1O35709 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Enc1O35709 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Enc1O35709 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Enc1O35709 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Enc1O35709 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Enc1O35709 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Enc1O35709 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Enc1O35709 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Enc1O35709 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Enc1O35709 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Enc1O35709 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Enc1O35709 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Enc1O35709 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Enc1O35709 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Enc1O35709 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Enc1O35709 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Enc1O35709 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Enc1O35709 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Enc1O35709 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Enc1O35709 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Enc1O35709 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Enc1O35709 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Enc1O35709 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Enc1O35709 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Enc1O35709 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Enc1O35709 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Enc1O35709 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Enc1O35709 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Enc1O35709 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Enc1O35709 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Enc1O35709 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Enc1O35709 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Enc1O35709 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Enc1O35709 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Enc1O35709 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Enc1O35709 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Enc1O35709 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Enc1O35709 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Enc1O35709 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms