Protein–RNA interactions for Protein: O35551

Rabep1, Rab GTPase-binding effector protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 862 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rabep1O35551 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Rabep1O35551 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Rabep1O35551 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Rabep1O35551 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Rabep1O35551 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Rabep1O35551 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Rabep1O35551 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Rabep1O35551 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Rabep1O35551 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Rabep1O35551 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Rabep1O35551 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Rabep1O35551 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Rabep1O35551 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Rabep1O35551 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Rabep1O35551 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Rabep1O35551 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Rabep1O35551 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Rabep1O35551 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Rabep1O35551 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Rabep1O35551 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Rabep1O35551 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Rabep1O35551 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Rabep1O35551 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Rabep1O35551 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Rabep1O35551 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Rabep1O35551 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Rabep1O35551 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Rabep1O35551 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Rabep1O35551 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Rabep1O35551 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Rabep1O35551 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Rabep1O35551 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Rabep1O35551 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Rabep1O35551 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Rabep1O35551 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Rabep1O35551 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Rabep1O35551 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Rabep1O35551 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Rabep1O35551 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Rabep1O35551 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Rabep1O35551 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Rabep1O35551 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Rabep1O35551 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Rabep1O35551 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Rabep1O35551 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Rabep1O35551 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Rabep1O35551 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
Rabep1O35551 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
Rabep1O35551 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Rabep1O35551 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Rabep1O35551 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Rabep1O35551 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Rabep1O35551 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Rabep1O35551 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Rabep1O35551 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Rabep1O35551 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Rabep1O35551 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Rabep1O35551 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Rabep1O35551 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Rabep1O35551 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Rabep1O35551 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Rabep1O35551 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Rabep1O35551 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Rabep1O35551 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Rabep1O35551 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Rabep1O35551 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Rabep1O35551 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Rabep1O35551 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Rabep1O35551 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Rabep1O35551 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Rabep1O35551 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Rabep1O35551 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Rabep1O35551 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Rabep1O35551 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Rabep1O35551 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Rabep1O35551 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Rabep1O35551 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Rabep1O35551 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Rabep1O35551 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Rabep1O35551 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Rabep1O35551 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Rabep1O35551 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Rabep1O35551 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Rabep1O35551 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Rabep1O35551 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Rabep1O35551 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Rabep1O35551 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Rabep1O35551 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Rabep1O35551 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Rabep1O35551 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Rabep1O35551 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Rabep1O35551 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Rabep1O35551 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Rabep1O35551 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Rabep1O35551 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Rabep1O35551 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Rabep1O35551 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Rabep1O35551 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Rabep1O35551 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Rabep1O35551 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78.7 ms