Protein–RNA interactions for Protein: O35445

Rnf5, E3 ubiquitin-protein ligase RNF5, mousemouse

Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf5O35445 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rnf5O35445 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rnf5O35445 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rnf5O35445 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rnf5O35445 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rnf5O35445 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rnf5O35445 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rnf5O35445 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Rnf5O35445 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rnf5O35445 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rnf5O35445 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Rnf5O35445 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rnf5O35445 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rnf5O35445 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rnf5O35445 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rnf5O35445 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Rnf5O35445 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rnf5O35445 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rnf5O35445 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rnf5O35445 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rnf5O35445 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rnf5O35445 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rnf5O35445 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rnf5O35445 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rnf5O35445 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rnf5O35445 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rnf5O35445 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rnf5O35445 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rnf5O35445 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rnf5O35445 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rnf5O35445 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rnf5O35445 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rnf5O35445 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rnf5O35445 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rnf5O35445 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Rnf5O35445 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Rnf5O35445 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rnf5O35445 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rnf5O35445 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rnf5O35445 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rnf5O35445 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rnf5O35445 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rnf5O35445 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rnf5O35445 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rnf5O35445 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rnf5O35445 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rnf5O35445 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rnf5O35445 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rnf5O35445 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rnf5O35445 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rnf5O35445 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Rnf5O35445 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rnf5O35445 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rnf5O35445 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rnf5O35445 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rnf5O35445 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rnf5O35445 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Rnf5O35445 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rnf5O35445 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rnf5O35445 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rnf5O35445 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rnf5O35445 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rnf5O35445 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rnf5O35445 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rnf5O35445 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rnf5O35445 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rnf5O35445 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rnf5O35445 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rnf5O35445 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rnf5O35445 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rnf5O35445 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rnf5O35445 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rnf5O35445 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Rnf5O35445 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rnf5O35445 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rnf5O35445 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rnf5O35445 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rnf5O35445 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rnf5O35445 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rnf5O35445 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rnf5O35445 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Rnf5O35445 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rnf5O35445 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rnf5O35445 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rnf5O35445 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rnf5O35445 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rnf5O35445 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Rnf5O35445 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rnf5O35445 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rnf5O35445 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rnf5O35445 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rnf5O35445 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rnf5O35445 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rnf5O35445 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rnf5O35445 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Rnf5O35445 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rnf5O35445 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rnf5O35445 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rnf5O35445 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rnf5O35445 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46 ms