Protein–RNA interactions for Protein: O35424

H2-Ob, Histocompatibility 2, O region beta locus, mousemouse

Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-ObO35424 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
H2-ObO35424 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
H2-ObO35424 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
H2-ObO35424 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
H2-ObO35424 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
H2-ObO35424 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
H2-ObO35424 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
H2-ObO35424 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
H2-ObO35424 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
H2-ObO35424 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
H2-ObO35424 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
H2-ObO35424 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
H2-ObO35424 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
H2-ObO35424 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
H2-ObO35424 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
H2-ObO35424 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
H2-ObO35424 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
H2-ObO35424 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
H2-ObO35424 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
H2-ObO35424 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
H2-ObO35424 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
H2-ObO35424 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
H2-ObO35424 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
H2-ObO35424 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
H2-ObO35424 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
H2-ObO35424 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
H2-ObO35424 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
H2-ObO35424 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
H2-ObO35424 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
H2-ObO35424 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
H2-ObO35424 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
H2-ObO35424 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
H2-ObO35424 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
H2-ObO35424 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
H2-ObO35424 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
H2-ObO35424 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
H2-ObO35424 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
H2-ObO35424 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC18■□□□□ 0.47
H2-ObO35424 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
H2-ObO35424 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
H2-ObO35424 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
H2-ObO35424 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
H2-ObO35424 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
H2-ObO35424 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
H2-ObO35424 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
H2-ObO35424 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
H2-ObO35424 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
H2-ObO35424 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
H2-ObO35424 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
H2-ObO35424 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
H2-ObO35424 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
H2-ObO35424 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
H2-ObO35424 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
H2-ObO35424 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
H2-ObO35424 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
H2-ObO35424 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
H2-ObO35424 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
H2-ObO35424 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
H2-ObO35424 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
H2-ObO35424 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
H2-ObO35424 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
H2-ObO35424 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
H2-ObO35424 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
H2-ObO35424 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
H2-ObO35424 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
H2-ObO35424 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
H2-ObO35424 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
H2-ObO35424 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
H2-ObO35424 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
H2-ObO35424 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
H2-ObO35424 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
H2-ObO35424 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
H2-ObO35424 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
H2-ObO35424 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
H2-ObO35424 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
H2-ObO35424 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
H2-ObO35424 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
H2-ObO35424 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
H2-ObO35424 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
H2-ObO35424 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
H2-ObO35424 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
H2-ObO35424 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
H2-ObO35424 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
H2-ObO35424 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
H2-ObO35424 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
H2-ObO35424 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
H2-ObO35424 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
H2-ObO35424 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
H2-ObO35424 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
H2-ObO35424 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
H2-ObO35424 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
H2-ObO35424 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
H2-ObO35424 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
H2-ObO35424 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
H2-ObO35424 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
H2-ObO35424 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
H2-ObO35424 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
H2-ObO35424 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
H2-ObO35424 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
H2-ObO35424 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77.6 ms