Protein–RNA interactions for Protein: O15254

ACOX3, Peroxisomal acyl-coenzyme A oxidase 3, humanhuman

Predictions only

Length 700 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACOX3O15254 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ACOX3O15254 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ACOX3O15254 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
ACOX3O15254 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
ACOX3O15254 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
ACOX3O15254 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC21.29■■□□□ 1
ACOX3O15254 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
ACOX3O15254 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
ACOX3O15254 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ACOX3O15254 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ACOX3O15254 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ACOX3O15254 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ACOX3O15254 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
ACOX3O15254 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
ACOX3O15254 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC21.28■■□□□ 1
ACOX3O15254 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC21.28■■□□□ 1
ACOX3O15254 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ACOX3O15254 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
ACOX3O15254 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ACOX3O15254 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ACOX3O15254 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
ACOX3O15254 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ACOX3O15254 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ACOX3O15254 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ACOX3O15254 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ACOX3O15254 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ACOX3O15254 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC21.27■■□□□ 1
ACOX3O15254 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ACOX3O15254 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ACOX3O15254 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
ACOX3O15254 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ACOX3O15254 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ACOX3O15254 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ACOX3O15254 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ACOX3O15254 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ACOX3O15254 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ACOX3O15254 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ACOX3O15254 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ACOX3O15254 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ACOX3O15254 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ACOX3O15254 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ACOX3O15254 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ACOX3O15254 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ACOX3O15254 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ACOX3O15254 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ACOX3O15254 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ACOX3O15254 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ACOX3O15254 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ACOX3O15254 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ACOX3O15254 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ACOX3O15254 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ACOX3O15254 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ACOX3O15254 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ACOX3O15254 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
ACOX3O15254 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ACOX3O15254 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ACOX3O15254 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ACOX3O15254 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ACOX3O15254 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ACOX3O15254 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ACOX3O15254 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ACOX3O15254 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ACOX3O15254 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ACOX3O15254 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ACOX3O15254 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ACOX3O15254 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ACOX3O15254 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ACOX3O15254 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ACOX3O15254 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ACOX3O15254 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ACOX3O15254 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ACOX3O15254 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ACOX3O15254 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ACOX3O15254 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ACOX3O15254 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ACOX3O15254 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ACOX3O15254 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ACOX3O15254 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ACOX3O15254 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ACOX3O15254 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ACOX3O15254 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ACOX3O15254 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ACOX3O15254 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ACOX3O15254 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ACOX3O15254 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ACOX3O15254 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ACOX3O15254 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ACOX3O15254 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ACOX3O15254 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ACOX3O15254 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ACOX3O15254 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ACOX3O15254 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ACOX3O15254 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ACOX3O15254 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ACOX3O15254 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ACOX3O15254 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
ACOX3O15254 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ACOX3O15254 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ACOX3O15254 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ACOX3O15254 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 103.1 ms