Protein–RNA interactions for Protein: O14829

PPEF1, Serine/threonine-protein phosphatase with EF-hands 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 653 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPEF1O14829 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
PPEF1O14829 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
PPEF1O14829 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
PPEF1O14829 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
PPEF1O14829 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
PPEF1O14829 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
PPEF1O14829 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
PPEF1O14829 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
PPEF1O14829 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
PPEF1O14829 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
PPEF1O14829 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PPEF1O14829 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PPEF1O14829 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PPEF1O14829 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
PPEF1O14829 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PPEF1O14829 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PPEF1O14829 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
PPEF1O14829 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
PPEF1O14829 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
PPEF1O14829 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
PPEF1O14829 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PPEF1O14829 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
PPEF1O14829 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
PPEF1O14829 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
PPEF1O14829 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PPEF1O14829 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
PPEF1O14829 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PPEF1O14829 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
PPEF1O14829 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
PPEF1O14829 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
PPEF1O14829 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
PPEF1O14829 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
PPEF1O14829 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC27.58■■■□□ 2.01
PPEF1O14829 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
PPEF1O14829 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
PPEF1O14829 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
PPEF1O14829 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
PPEF1O14829 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
PPEF1O14829 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
PPEF1O14829 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
PPEF1O14829 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PPEF1O14829 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PPEF1O14829 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PPEF1O14829 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PPEF1O14829 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
PPEF1O14829 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PPEF1O14829 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PPEF1O14829 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PPEF1O14829 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
PPEF1O14829 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
PPEF1O14829 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PPEF1O14829 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
PPEF1O14829 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
PPEF1O14829 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC27.56■■■□□ 2
PPEF1O14829 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PPEF1O14829 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
PPEF1O14829 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
PPEF1O14829 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC27.56■■■□□ 2
PPEF1O14829 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
PPEF1O14829 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PPEF1O14829 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PPEF1O14829 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
PPEF1O14829 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PPEF1O14829 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PPEF1O14829 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PPEF1O14829 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC27.55■■■□□ 2
PPEF1O14829 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
PPEF1O14829 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PPEF1O14829 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PPEF1O14829 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PPEF1O14829 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PPEF1O14829 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PPEF1O14829 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC27.55■■■□□ 2
PPEF1O14829 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
PPEF1O14829 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
PPEF1O14829 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
PPEF1O14829 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
PPEF1O14829 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC27.54■■■□□ 2
PPEF1O14829 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
PPEF1O14829 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
PPEF1O14829 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC27.54■■■□□ 2
PPEF1O14829 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PPEF1O14829 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PPEF1O14829 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PPEF1O14829 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
PPEF1O14829 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PPEF1O14829 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
PPEF1O14829 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
PPEF1O14829 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PPEF1O14829 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PPEF1O14829 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
PPEF1O14829 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
PPEF1O14829 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
PPEF1O14829 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
PPEF1O14829 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
PPEF1O14829 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC27.52■■■□□ 2
PPEF1O14829 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
PPEF1O14829 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
PPEF1O14829 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
PPEF1O14829 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61 ms