Protein–RNA interactions for Protein: O08917

Flot1, Flotillin-1, mousemouse

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Flot1O08917 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Flot1O08917 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Flot1O08917 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Flot1O08917 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Flot1O08917 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Flot1O08917 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Flot1O08917 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Flot1O08917 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Flot1O08917 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Flot1O08917 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Flot1O08917 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Flot1O08917 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Flot1O08917 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Flot1O08917 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Flot1O08917 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Flot1O08917 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Flot1O08917 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Flot1O08917 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Flot1O08917 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Flot1O08917 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Flot1O08917 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Flot1O08917 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Flot1O08917 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Flot1O08917 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Flot1O08917 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Flot1O08917 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Flot1O08917 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Flot1O08917 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Flot1O08917 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Flot1O08917 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Flot1O08917 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Flot1O08917 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Flot1O08917 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Flot1O08917 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Flot1O08917 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Flot1O08917 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Flot1O08917 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Flot1O08917 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Flot1O08917 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Flot1O08917 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Flot1O08917 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Flot1O08917 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Flot1O08917 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Flot1O08917 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Flot1O08917 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Flot1O08917 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Flot1O08917 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Flot1O08917 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Flot1O08917 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Flot1O08917 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Flot1O08917 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Flot1O08917 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Flot1O08917 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Flot1O08917 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Flot1O08917 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Flot1O08917 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Flot1O08917 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Flot1O08917 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Flot1O08917 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Flot1O08917 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Flot1O08917 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Flot1O08917 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Flot1O08917 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Flot1O08917 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Flot1O08917 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Flot1O08917 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Flot1O08917 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Flot1O08917 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Flot1O08917 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Flot1O08917 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Flot1O08917 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Flot1O08917 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Flot1O08917 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Flot1O08917 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Flot1O08917 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Flot1O08917 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Flot1O08917 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Flot1O08917 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Flot1O08917 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Flot1O08917 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Flot1O08917 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Flot1O08917 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Flot1O08917 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Flot1O08917 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Flot1O08917 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Flot1O08917 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Flot1O08917 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Flot1O08917 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Flot1O08917 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Flot1O08917 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Flot1O08917 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Flot1O08917 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Flot1O08917 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Flot1O08917 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Flot1O08917 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Flot1O08917 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Flot1O08917 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Flot1O08917 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Flot1O08917 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Flot1O08917 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms