Protein–RNA interactions for Protein: J3QP38

Gm21900, Predicted gene, 21900, mousemouse

Predictions only

Length 180 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21900J3QP38 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
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Gm21900J3QP38 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm21900J3QP38 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm21900J3QP38 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm21900J3QP38 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm21900J3QP38 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm21900J3QP38 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm21900J3QP38 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm21900J3QP38 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm21900J3QP38 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm21900J3QP38 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm21900J3QP38 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm21900J3QP38 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm21900J3QP38 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
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Gm21900J3QP38 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm21900J3QP38 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm21900J3QP38 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
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Gm21900J3QP38 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm21900J3QP38 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm21900J3QP38 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm21900J3QP38 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm21900J3QP38 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm21900J3QP38 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm21900J3QP38 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
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Gm21900J3QP38 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm21900J3QP38 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm21900J3QP38 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm21900J3QP38 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm21900J3QP38 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm21900J3QP38 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm21900J3QP38 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
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Gm21900J3QP38 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm21900J3QP38 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
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Gm21900J3QP38 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm21900J3QP38 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm21900J3QP38 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm21900J3QP38 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm21900J3QP38 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
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Gm21900J3QP38 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
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Gm21900J3QP38 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gm21900J3QP38 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
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Gm21900J3QP38 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
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Gm21900J3QP38 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
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Gm21900J3QP38 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
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Gm21900J3QP38 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm21900J3QP38 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
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Gm21900J3QP38 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm21900J3QP38 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm21900J3QP38 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm21900J3QP38 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm21900J3QP38 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm21900J3QP38 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm21900J3QP38 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm21900J3QP38 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm21900J3QP38 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm21900J3QP38 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm21900J3QP38 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm21900J3QP38 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm21900J3QP38 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
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Gm21900J3QP38 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm21900J3QP38 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
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Gm21900J3QP38 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
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