Protein–RNA interactions for Protein: J3QK46

Tmem200c, Transmembrane protein 200C, mousemouse

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Length 637 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem200cJ3QK46 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
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Tmem200cJ3QK46 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
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Tmem200cJ3QK46 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tmem200cJ3QK46 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tmem200cJ3QK46 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
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Tmem200cJ3QK46 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tmem200cJ3QK46 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Tmem200cJ3QK46 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tmem200cJ3QK46 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
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Tmem200cJ3QK46 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
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Tmem200cJ3QK46 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
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Tmem200cJ3QK46 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Tmem200cJ3QK46 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Tmem200cJ3QK46 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Tmem200cJ3QK46 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Tmem200cJ3QK46 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Tmem200cJ3QK46 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Tmem200cJ3QK46 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Tmem200cJ3QK46 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Tmem200cJ3QK46 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Tmem200cJ3QK46 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Tmem200cJ3QK46 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Tmem200cJ3QK46 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Tmem200cJ3QK46 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Tmem200cJ3QK46 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Tmem200cJ3QK46 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
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Tmem200cJ3QK46 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Tmem200cJ3QK46 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
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Tmem200cJ3QK46 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
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