Protein–RNA interactions for Protein: J3QJW5

Cldn34c3, Claudin 34C3, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34c3J3QJW5 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cldn34c3J3QJW5 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cldn34c3J3QJW5 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cldn34c3J3QJW5 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cldn34c3J3QJW5 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cldn34c3J3QJW5 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cldn34c3J3QJW5 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cldn34c3J3QJW5 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cldn34c3J3QJW5 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cldn34c3J3QJW5 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Cldn34c3J3QJW5 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cldn34c3J3QJW5 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cldn34c3J3QJW5 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cldn34c3J3QJW5 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cldn34c3J3QJW5 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cldn34c3J3QJW5 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cldn34c3J3QJW5 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cldn34c3J3QJW5 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cldn34c3J3QJW5 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cldn34c3J3QJW5 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cldn34c3J3QJW5 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cldn34c3J3QJW5 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cldn34c3J3QJW5 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cldn34c3J3QJW5 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cldn34c3J3QJW5 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cldn34c3J3QJW5 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cldn34c3J3QJW5 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cldn34c3J3QJW5 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cldn34c3J3QJW5 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cldn34c3J3QJW5 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cldn34c3J3QJW5 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cldn34c3J3QJW5 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cldn34c3J3QJW5 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cldn34c3J3QJW5 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cldn34c3J3QJW5 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cldn34c3J3QJW5 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cldn34c3J3QJW5 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cldn34c3J3QJW5 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cldn34c3J3QJW5 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cldn34c3J3QJW5 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cldn34c3J3QJW5 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cldn34c3J3QJW5 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Cldn34c3J3QJW5 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cldn34c3J3QJW5 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cldn34c3J3QJW5 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cldn34c3J3QJW5 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cldn34c3J3QJW5 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cldn34c3J3QJW5 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cldn34c3J3QJW5 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cldn34c3J3QJW5 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cldn34c3J3QJW5 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cldn34c3J3QJW5 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cldn34c3J3QJW5 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cldn34c3J3QJW5 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cldn34c3J3QJW5 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cldn34c3J3QJW5 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cldn34c3J3QJW5 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cldn34c3J3QJW5 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cldn34c3J3QJW5 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Cldn34c3J3QJW5 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Cldn34c3J3QJW5 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cldn34c3J3QJW5 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cldn34c3J3QJW5 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cldn34c3J3QJW5 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cldn34c3J3QJW5 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cldn34c3J3QJW5 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cldn34c3J3QJW5 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cldn34c3J3QJW5 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cldn34c3J3QJW5 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cldn34c3J3QJW5 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cldn34c3J3QJW5 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cldn34c3J3QJW5 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cldn34c3J3QJW5 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cldn34c3J3QJW5 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Cldn34c3J3QJW5 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cldn34c3J3QJW5 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cldn34c3J3QJW5 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cldn34c3J3QJW5 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cldn34c3J3QJW5 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cldn34c3J3QJW5 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cldn34c3J3QJW5 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Cldn34c3J3QJW5 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cldn34c3J3QJW5 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cldn34c3J3QJW5 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cldn34c3J3QJW5 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cldn34c3J3QJW5 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cldn34c3J3QJW5 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cldn34c3J3QJW5 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cldn34c3J3QJW5 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cldn34c3J3QJW5 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cldn34c3J3QJW5 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cldn34c3J3QJW5 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cldn34c3J3QJW5 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cldn34c3J3QJW5 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cldn34c3J3QJW5 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cldn34c3J3QJW5 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cldn34c3J3QJW5 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cldn34c3J3QJW5 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Cldn34c3J3QJW5 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cldn34c3J3QJW5 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
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