Protein–RNA interactions for Protein: F7CNM6

1700056E22Rik, RIKEN cDNA 1700056E22 gene, mousemouse

Predictions only

Length 234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700056E22RikF7CNM6 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
1700056E22RikF7CNM6 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
1700056E22RikF7CNM6 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
1700056E22RikF7CNM6 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
1700056E22RikF7CNM6 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
1700056E22RikF7CNM6 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
1700056E22RikF7CNM6 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
1700056E22RikF7CNM6 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
1700056E22RikF7CNM6 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
1700056E22RikF7CNM6 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
1700056E22RikF7CNM6 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
1700056E22RikF7CNM6 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
1700056E22RikF7CNM6 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
1700056E22RikF7CNM6 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
1700056E22RikF7CNM6 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
1700056E22RikF7CNM6 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
1700056E22RikF7CNM6 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
1700056E22RikF7CNM6 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
1700056E22RikF7CNM6 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
1700056E22RikF7CNM6 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
1700056E22RikF7CNM6 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
1700056E22RikF7CNM6 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
1700056E22RikF7CNM6 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
1700056E22RikF7CNM6 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
1700056E22RikF7CNM6 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
1700056E22RikF7CNM6 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
1700056E22RikF7CNM6 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
1700056E22RikF7CNM6 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
1700056E22RikF7CNM6 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
1700056E22RikF7CNM6 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
1700056E22RikF7CNM6 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
1700056E22RikF7CNM6 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
1700056E22RikF7CNM6 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
1700056E22RikF7CNM6 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
1700056E22RikF7CNM6 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
1700056E22RikF7CNM6 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
1700056E22RikF7CNM6 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
1700056E22RikF7CNM6 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
1700056E22RikF7CNM6 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
1700056E22RikF7CNM6 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
1700056E22RikF7CNM6 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
1700056E22RikF7CNM6 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
1700056E22RikF7CNM6 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
1700056E22RikF7CNM6 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
1700056E22RikF7CNM6 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
1700056E22RikF7CNM6 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
1700056E22RikF7CNM6 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
1700056E22RikF7CNM6 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
1700056E22RikF7CNM6 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
1700056E22RikF7CNM6 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
1700056E22RikF7CNM6 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
1700056E22RikF7CNM6 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
1700056E22RikF7CNM6 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
1700056E22RikF7CNM6 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
1700056E22RikF7CNM6 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
1700056E22RikF7CNM6 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
1700056E22RikF7CNM6 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
1700056E22RikF7CNM6 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
1700056E22RikF7CNM6 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
1700056E22RikF7CNM6 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
1700056E22RikF7CNM6 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
1700056E22RikF7CNM6 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
1700056E22RikF7CNM6 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
1700056E22RikF7CNM6 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
1700056E22RikF7CNM6 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
1700056E22RikF7CNM6 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
1700056E22RikF7CNM6 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
1700056E22RikF7CNM6 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
1700056E22RikF7CNM6 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
1700056E22RikF7CNM6 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
1700056E22RikF7CNM6 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
1700056E22RikF7CNM6 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
1700056E22RikF7CNM6 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
1700056E22RikF7CNM6 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
1700056E22RikF7CNM6 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
1700056E22RikF7CNM6 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
1700056E22RikF7CNM6 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
1700056E22RikF7CNM6 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
1700056E22RikF7CNM6 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
1700056E22RikF7CNM6 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
1700056E22RikF7CNM6 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
1700056E22RikF7CNM6 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
1700056E22RikF7CNM6 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
1700056E22RikF7CNM6 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
1700056E22RikF7CNM6 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
1700056E22RikF7CNM6 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
1700056E22RikF7CNM6 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
1700056E22RikF7CNM6 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
1700056E22RikF7CNM6 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
1700056E22RikF7CNM6 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
1700056E22RikF7CNM6 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
1700056E22RikF7CNM6 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
1700056E22RikF7CNM6 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
1700056E22RikF7CNM6 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
1700056E22RikF7CNM6 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
1700056E22RikF7CNM6 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
1700056E22RikF7CNM6 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
1700056E22RikF7CNM6 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
1700056E22RikF7CNM6 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
1700056E22RikF7CNM6 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.6 ms