Protein–RNA interactions for Protein: F6U3N7

Gm21977, Predicted gene 21977 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21977F6U3N7 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm21977F6U3N7 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm21977F6U3N7 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm21977F6U3N7 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm21977F6U3N7 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm21977F6U3N7 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm21977F6U3N7 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm21977F6U3N7 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm21977F6U3N7 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm21977F6U3N7 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm21977F6U3N7 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gm21977F6U3N7 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gm21977F6U3N7 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gm21977F6U3N7 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gm21977F6U3N7 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gm21977F6U3N7 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gm21977F6U3N7 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gm21977F6U3N7 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gm21977F6U3N7 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gm21977F6U3N7 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gm21977F6U3N7 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gm21977F6U3N7 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gm21977F6U3N7 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gm21977F6U3N7 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gm21977F6U3N7 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gm21977F6U3N7 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gm21977F6U3N7 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Gm21977F6U3N7 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gm21977F6U3N7 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gm21977F6U3N7 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gm21977F6U3N7 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Gm21977F6U3N7 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Gm21977F6U3N7 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Gm21977F6U3N7 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Gm21977F6U3N7 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gm21977F6U3N7 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gm21977F6U3N7 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gm21977F6U3N7 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gm21977F6U3N7 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gm21977F6U3N7 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gm21977F6U3N7 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gm21977F6U3N7 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gm21977F6U3N7 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gm21977F6U3N7 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gm21977F6U3N7 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gm21977F6U3N7 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gm21977F6U3N7 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gm21977F6U3N7 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gm21977F6U3N7 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gm21977F6U3N7 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gm21977F6U3N7 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gm21977F6U3N7 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gm21977F6U3N7 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gm21977F6U3N7 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gm21977F6U3N7 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gm21977F6U3N7 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gm21977F6U3N7 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gm21977F6U3N7 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gm21977F6U3N7 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gm21977F6U3N7 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gm21977F6U3N7 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gm21977F6U3N7 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gm21977F6U3N7 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gm21977F6U3N7 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gm21977F6U3N7 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gm21977F6U3N7 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gm21977F6U3N7 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gm21977F6U3N7 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gm21977F6U3N7 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gm21977F6U3N7 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gm21977F6U3N7 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gm21977F6U3N7 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gm21977F6U3N7 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gm21977F6U3N7 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gm21977F6U3N7 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Gm21977F6U3N7 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gm21977F6U3N7 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gm21977F6U3N7 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gm21977F6U3N7 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gm21977F6U3N7 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gm21977F6U3N7 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gm21977F6U3N7 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gm21977F6U3N7 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gm21977F6U3N7 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gm21977F6U3N7 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gm21977F6U3N7 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gm21977F6U3N7 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gm21977F6U3N7 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Gm21977F6U3N7 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gm21977F6U3N7 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gm21977F6U3N7 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gm21977F6U3N7 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gm21977F6U3N7 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gm21977F6U3N7 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gm21977F6U3N7 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gm21977F6U3N7 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gm21977F6U3N7 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gm21977F6U3N7 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gm21977F6U3N7 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gm21977F6U3N7 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms