Protein–RNA interactions for Protein: E9Q7P2

Cacna1i, Voltage-dependent T-type calcium channel subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 2,199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna1iE9Q7P2 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cacna1iE9Q7P2 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cacna1iE9Q7P2 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cacna1iE9Q7P2 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cacna1iE9Q7P2 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cacna1iE9Q7P2 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cacna1iE9Q7P2 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cacna1iE9Q7P2 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cacna1iE9Q7P2 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cacna1iE9Q7P2 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cacna1iE9Q7P2 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cacna1iE9Q7P2 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cacna1iE9Q7P2 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cacna1iE9Q7P2 Gm37720-201ENSMUST00000195497 1241 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Cacna1iE9Q7P2 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cacna1iE9Q7P2 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cacna1iE9Q7P2 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cacna1iE9Q7P2 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cacna1iE9Q7P2 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cacna1iE9Q7P2 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cacna1iE9Q7P2 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cacna1iE9Q7P2 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cacna1iE9Q7P2 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cacna1iE9Q7P2 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cacna1iE9Q7P2 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Cacna1iE9Q7P2 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Cacna1iE9Q7P2 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cacna1iE9Q7P2 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cacna1iE9Q7P2 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cacna1iE9Q7P2 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cacna1iE9Q7P2 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cacna1iE9Q7P2 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cacna1iE9Q7P2 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cacna1iE9Q7P2 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cacna1iE9Q7P2 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cacna1iE9Q7P2 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cacna1iE9Q7P2 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cacna1iE9Q7P2 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cacna1iE9Q7P2 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cacna1iE9Q7P2 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cacna1iE9Q7P2 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cacna1iE9Q7P2 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cacna1iE9Q7P2 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cacna1iE9Q7P2 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cacna1iE9Q7P2 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cacna1iE9Q7P2 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cacna1iE9Q7P2 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cacna1iE9Q7P2 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cacna1iE9Q7P2 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cacna1iE9Q7P2 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cacna1iE9Q7P2 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Cacna1iE9Q7P2 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cacna1iE9Q7P2 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cacna1iE9Q7P2 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cacna1iE9Q7P2 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cacna1iE9Q7P2 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Cacna1iE9Q7P2 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cacna1iE9Q7P2 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cacna1iE9Q7P2 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cacna1iE9Q7P2 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cacna1iE9Q7P2 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Cacna1iE9Q7P2 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cacna1iE9Q7P2 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cacna1iE9Q7P2 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cacna1iE9Q7P2 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cacna1iE9Q7P2 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cacna1iE9Q7P2 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cacna1iE9Q7P2 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cacna1iE9Q7P2 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Cacna1iE9Q7P2 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cacna1iE9Q7P2 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cacna1iE9Q7P2 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Cacna1iE9Q7P2 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cacna1iE9Q7P2 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cacna1iE9Q7P2 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cacna1iE9Q7P2 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cacna1iE9Q7P2 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cacna1iE9Q7P2 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cacna1iE9Q7P2 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cacna1iE9Q7P2 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cacna1iE9Q7P2 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cacna1iE9Q7P2 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cacna1iE9Q7P2 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cacna1iE9Q7P2 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cacna1iE9Q7P2 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cacna1iE9Q7P2 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cacna1iE9Q7P2 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cacna1iE9Q7P2 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cacna1iE9Q7P2 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cacna1iE9Q7P2 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cacna1iE9Q7P2 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cacna1iE9Q7P2 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cacna1iE9Q7P2 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cacna1iE9Q7P2 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cacna1iE9Q7P2 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cacna1iE9Q7P2 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cacna1iE9Q7P2 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cacna1iE9Q7P2 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cacna1iE9Q7P2 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cacna1iE9Q7P2 Gm20865-201ENSMUST00000179095 856 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.1 ms