Protein–RNA interactions for Protein: E9PVP9

Gm4884, Predicted gene 4884, mousemouse

Predictions only

Length 694 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm4884E9PVP9 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gm4884E9PVP9 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gm4884E9PVP9 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gm4884E9PVP9 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gm4884E9PVP9 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gm4884E9PVP9 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gm4884E9PVP9 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gm4884E9PVP9 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gm4884E9PVP9 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gm4884E9PVP9 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm4884E9PVP9 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm4884E9PVP9 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm4884E9PVP9 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm4884E9PVP9 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm4884E9PVP9 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm4884E9PVP9 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm4884E9PVP9 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm4884E9PVP9 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm4884E9PVP9 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm4884E9PVP9 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm4884E9PVP9 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm4884E9PVP9 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm4884E9PVP9 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm4884E9PVP9 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm4884E9PVP9 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm4884E9PVP9 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm4884E9PVP9 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm4884E9PVP9 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm4884E9PVP9 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm4884E9PVP9 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm4884E9PVP9 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm4884E9PVP9 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm4884E9PVP9 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm4884E9PVP9 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm4884E9PVP9 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm4884E9PVP9 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm4884E9PVP9 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm4884E9PVP9 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm4884E9PVP9 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm4884E9PVP9 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm4884E9PVP9 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm4884E9PVP9 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm4884E9PVP9 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm4884E9PVP9 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm4884E9PVP9 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm4884E9PVP9 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm4884E9PVP9 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm4884E9PVP9 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm4884E9PVP9 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm4884E9PVP9 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm4884E9PVP9 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm4884E9PVP9 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm4884E9PVP9 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm4884E9PVP9 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm4884E9PVP9 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm4884E9PVP9 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm4884E9PVP9 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm4884E9PVP9 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm4884E9PVP9 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Gm4884E9PVP9 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Gm4884E9PVP9 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Gm4884E9PVP9 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Gm4884E9PVP9 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm4884E9PVP9 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm4884E9PVP9 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm4884E9PVP9 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm4884E9PVP9 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm4884E9PVP9 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm4884E9PVP9 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm4884E9PVP9 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm4884E9PVP9 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm4884E9PVP9 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm4884E9PVP9 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm4884E9PVP9 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm4884E9PVP9 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm4884E9PVP9 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm4884E9PVP9 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm4884E9PVP9 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm4884E9PVP9 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm4884E9PVP9 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm4884E9PVP9 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm4884E9PVP9 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm4884E9PVP9 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm4884E9PVP9 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm4884E9PVP9 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm4884E9PVP9 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm4884E9PVP9 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm4884E9PVP9 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm4884E9PVP9 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm4884E9PVP9 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm4884E9PVP9 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm4884E9PVP9 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm4884E9PVP9 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm4884E9PVP9 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm4884E9PVP9 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm4884E9PVP9 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm4884E9PVP9 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm4884E9PVP9 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm4884E9PVP9 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm4884E9PVP9 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms